Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CSRP2Q16527 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CSRP2Q16527 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CSRP2Q16527 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CSRP2Q16527 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSRP2Q16527 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSRP2Q16527 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSRP2Q16527 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSRP2Q16527 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CSRP2Q16527 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CSRP2Q16527 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CSRP2Q16527 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSRP2Q16527 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CSRP2Q16527 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CSRP2Q16527 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CSRP2Q16527 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSRP2Q16527 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSRP2Q16527 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CSRP2Q16527 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CSRP2Q16527 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CSRP2Q16527 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CSRP2Q16527 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CSRP2Q16527 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CSRP2Q16527 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CSRP2Q16527 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CSRP2Q16527 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CSRP2Q16527 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CSRP2Q16527 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CSRP2Q16527 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CSRP2Q16527 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CSRP2Q16527 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CSRP2Q16527 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CSRP2Q16527 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CSRP2Q16527 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CSRP2Q16527 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CSRP2Q16527 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CSRP2Q16527 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CSRP2Q16527 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CSRP2Q16527 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CSRP2Q16527 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CSRP2Q16527 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CSRP2Q16527 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CSRP2Q16527 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CSRP2Q16527 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CSRP2Q16527 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CSRP2Q16527 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CSRP2Q16527 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CSRP2Q16527 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CSRP2Q16527 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CSRP2Q16527 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CSRP2Q16527 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CSRP2Q16527 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSRP2Q16527 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSRP2Q16527 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSRP2Q16527 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSRP2Q16527 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CSRP2Q16527 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CSRP2Q16527 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CSRP2Q16527 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CSRP2Q16527 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CSRP2Q16527 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CSRP2Q16527 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CSRP2Q16527 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CSRP2Q16527 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CSRP2Q16527 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CSRP2Q16527 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSRP2Q16527 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSRP2Q16527 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSRP2Q16527 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSRP2Q16527 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSRP2Q16527 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CSRP2Q16527 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CSRP2Q16527 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
CSRP2Q16527 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CSRP2Q16527 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CSRP2Q16527 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CSRP2Q16527 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CSRP2Q16527 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CSRP2Q16527 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CSRP2Q16527 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CSRP2Q16527 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CSRP2Q16527 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CSRP2Q16527 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CSRP2Q16527 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CSRP2Q16527 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CSRP2Q16527 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CSRP2Q16527 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CSRP2Q16527 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CSRP2Q16527 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CSRP2Q16527 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSRP2Q16527 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSRP2Q16527 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CSRP2Q16527 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CSRP2Q16527 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CSRP2Q16527 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSRP2Q16527 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSRP2Q16527 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSRP2Q16527 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSRP2Q16527 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSRP2Q16527 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms