Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDCD2Q16342 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDCD2Q16342 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDCD2Q16342 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDCD2Q16342 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDCD2Q16342 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDCD2Q16342 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDCD2Q16342 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDCD2Q16342 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDCD2Q16342 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDCD2Q16342 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDCD2Q16342 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDCD2Q16342 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PDCD2Q16342 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDCD2Q16342 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDCD2Q16342 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDCD2Q16342 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDCD2Q16342 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDCD2Q16342 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDCD2Q16342 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDCD2Q16342 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDCD2Q16342 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDCD2Q16342 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDCD2Q16342 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDCD2Q16342 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDCD2Q16342 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDCD2Q16342 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDCD2Q16342 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDCD2Q16342 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDCD2Q16342 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDCD2Q16342 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDCD2Q16342 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDCD2Q16342 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDCD2Q16342 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDCD2Q16342 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDCD2Q16342 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDCD2Q16342 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDCD2Q16342 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDCD2Q16342 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDCD2Q16342 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDCD2Q16342 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDCD2Q16342 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PDCD2Q16342 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDCD2Q16342 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDCD2Q16342 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDCD2Q16342 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDCD2Q16342 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDCD2Q16342 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PDCD2Q16342 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDCD2Q16342 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDCD2Q16342 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDCD2Q16342 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDCD2Q16342 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDCD2Q16342 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDCD2Q16342 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDCD2Q16342 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDCD2Q16342 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDCD2Q16342 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDCD2Q16342 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDCD2Q16342 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDCD2Q16342 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDCD2Q16342 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDCD2Q16342 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDCD2Q16342 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PDCD2Q16342 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDCD2Q16342 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDCD2Q16342 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDCD2Q16342 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDCD2Q16342 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDCD2Q16342 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDCD2Q16342 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDCD2Q16342 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDCD2Q16342 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDCD2Q16342 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDCD2Q16342 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDCD2Q16342 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDCD2Q16342 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDCD2Q16342 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDCD2Q16342 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDCD2Q16342 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDCD2Q16342 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDCD2Q16342 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDCD2Q16342 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDCD2Q16342 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDCD2Q16342 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDCD2Q16342 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDCD2Q16342 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDCD2Q16342 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDCD2Q16342 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDCD2Q16342 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PDCD2Q16342 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDCD2Q16342 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDCD2Q16342 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDCD2Q16342 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PDCD2Q16342 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PDCD2Q16342 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PDCD2Q16342 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDCD2Q16342 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDCD2Q16342 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDCD2Q16342 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
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