Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
GTF3C1Q12789 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF3C1Q12789 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF3C1Q12789 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF3C1Q12789 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF3C1Q12789 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF3C1Q12789 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF3C1Q12789 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF3C1Q12789 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF3C1Q12789 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF3C1Q12789 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF3C1Q12789 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF3C1Q12789 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF3C1Q12789 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF3C1Q12789 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF3C1Q12789 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF3C1Q12789 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF3C1Q12789 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF3C1Q12789 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF3C1Q12789 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF3C1Q12789 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF3C1Q12789 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF3C1Q12789 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF3C1Q12789 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF3C1Q12789 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF3C1Q12789 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF3C1Q12789 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF3C1Q12789 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF3C1Q12789 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF3C1Q12789 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF3C1Q12789 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF3C1Q12789 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF3C1Q12789 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF3C1Q12789 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF3C1Q12789 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF3C1Q12789 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF3C1Q12789 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF3C1Q12789 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF3C1Q12789 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF3C1Q12789 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF3C1Q12789 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GTF3C1Q12789 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GTF3C1Q12789 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF3C1Q12789 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF3C1Q12789 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF3C1Q12789 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF3C1Q12789 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF3C1Q12789 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF3C1Q12789 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF3C1Q12789 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF3C1Q12789 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF3C1Q12789 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF3C1Q12789 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF3C1Q12789 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF3C1Q12789 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF3C1Q12789 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF3C1Q12789 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF3C1Q12789 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF3C1Q12789 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF3C1Q12789 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF3C1Q12789 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF3C1Q12789 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF3C1Q12789 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF3C1Q12789 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF3C1Q12789 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF3C1Q12789 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF3C1Q12789 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF3C1Q12789 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF3C1Q12789 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF3C1Q12789 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF3C1Q12789 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF3C1Q12789 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GTF3C1Q12789 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF3C1Q12789 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF3C1Q12789 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF3C1Q12789 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF3C1Q12789 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF3C1Q12789 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF3C1Q12789 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C1Q12789 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C1Q12789 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C1Q12789 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C1Q12789 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C1Q12789 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C1Q12789 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C1Q12789 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C1Q12789 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C1Q12789 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF3C1Q12789 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF3C1Q12789 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GTF3C1Q12789 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF3C1Q12789 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF3C1Q12789 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF3C1Q12789 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF3C1Q12789 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF3C1Q12789 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF3C1Q12789 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF3C1Q12789 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GTF3C1Q12789 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF3C1Q12789 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
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