Protein–RNA interactions for Protein: Q06330

RBPJ, Recombining binding protein suppressor of hairless, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBPJQ06330 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBPJQ06330 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBPJQ06330 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBPJQ06330 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RBPJQ06330 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBPJQ06330 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBPJQ06330 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RBPJQ06330 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBPJQ06330 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RBPJQ06330 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RBPJQ06330 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RBPJQ06330 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBPJQ06330 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBPJQ06330 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBPJQ06330 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBPJQ06330 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBPJQ06330 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBPJQ06330 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBPJQ06330 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RBPJQ06330 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBPJQ06330 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBPJQ06330 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBPJQ06330 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBPJQ06330 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBPJQ06330 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBPJQ06330 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBPJQ06330 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBPJQ06330 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RBPJQ06330 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
RBPJQ06330 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBPJQ06330 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RBPJQ06330 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBPJQ06330 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBPJQ06330 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBPJQ06330 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBPJQ06330 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RBPJQ06330 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBPJQ06330 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBPJQ06330 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBPJQ06330 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBPJQ06330 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBPJQ06330 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBPJQ06330 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBPJQ06330 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBPJQ06330 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBPJQ06330 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBPJQ06330 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBPJQ06330 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBPJQ06330 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBPJQ06330 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RBPJQ06330 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RBPJQ06330 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBPJQ06330 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBPJQ06330 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBPJQ06330 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBPJQ06330 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBPJQ06330 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBPJQ06330 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RBPJQ06330 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBPJQ06330 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBPJQ06330 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RBPJQ06330 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBPJQ06330 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RBPJQ06330 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RBPJQ06330 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBPJQ06330 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBPJQ06330 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RBPJQ06330 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RBPJQ06330 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBPJQ06330 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBPJQ06330 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBPJQ06330 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBPJQ06330 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RBPJQ06330 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBPJQ06330 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBPJQ06330 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBPJQ06330 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBPJQ06330 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBPJQ06330 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBPJQ06330 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBPJQ06330 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBPJQ06330 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RBPJQ06330 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RBPJQ06330 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBPJQ06330 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBPJQ06330 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBPJQ06330 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBPJQ06330 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBPJQ06330 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBPJQ06330 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBPJQ06330 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBPJQ06330 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RBPJQ06330 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBPJQ06330 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RBPJQ06330 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RBPJQ06330 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RBPJQ06330 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBPJQ06330 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBPJQ06330 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBPJQ06330 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms