Protein–RNA interactions for Protein: Q04912

MST1R, Macrophage-stimulating protein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MST1RQ04912 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.67■■■■□ 3.94
MST1RQ04912 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC39.66■■■■□ 3.94
MST1RQ04912 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.65■■■■□ 3.94
MST1RQ04912 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC39.65■■■■□ 3.94
MST1RQ04912 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
MST1RQ04912 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
MST1RQ04912 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC39.57■■■■□ 3.92
MST1RQ04912 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC39.55■■■■□ 3.92
MST1RQ04912 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
MST1RQ04912 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
MST1RQ04912 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
MST1RQ04912 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC39.52■■■■□ 3.92
MST1RQ04912 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
MST1RQ04912 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
MST1RQ04912 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC39.48■■■■□ 3.91
MST1RQ04912 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC39.46■■■■□ 3.91
MST1RQ04912 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
MST1RQ04912 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC39.46■■■■□ 3.91
MST1RQ04912 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC39.44■■■■□ 3.9
MST1RQ04912 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC39.43■■■■□ 3.9
MST1RQ04912 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC39.42■■■■□ 3.9
MST1RQ04912 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
MST1RQ04912 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.41■■■■□ 3.9
MST1RQ04912 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC39.4■■■■□ 3.9
MST1RQ04912 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC39.4■■■■□ 3.9
MST1RQ04912 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
MST1RQ04912 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
MST1RQ04912 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
MST1RQ04912 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
MST1RQ04912 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
MST1RQ04912 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
MST1RQ04912 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
MST1RQ04912 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
MST1RQ04912 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
MST1RQ04912 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
MST1RQ04912 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC39.22■■■■□ 3.87
MST1RQ04912 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC39.21■■■■□ 3.87
MST1RQ04912 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC39.2■■■■□ 3.87
MST1RQ04912 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
MST1RQ04912 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
MST1RQ04912 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
MST1RQ04912 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
MST1RQ04912 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
MST1RQ04912 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
MST1RQ04912 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.13■■■■□ 3.85
MST1RQ04912 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
MST1RQ04912 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC39.11■■■■□ 3.85
MST1RQ04912 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC39.11■■■■□ 3.85
MST1RQ04912 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC39.1■■■■□ 3.85
MST1RQ04912 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
MST1RQ04912 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
MST1RQ04912 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC39.07■■■■□ 3.84
MST1RQ04912 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
MST1RQ04912 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
MST1RQ04912 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
MST1RQ04912 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
MST1RQ04912 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
MST1RQ04912 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
MST1RQ04912 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
MST1RQ04912 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
MST1RQ04912 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
MST1RQ04912 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
MST1RQ04912 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
MST1RQ04912 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
MST1RQ04912 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
MST1RQ04912 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC38.9■■■■□ 3.82
MST1RQ04912 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC38.9■■■■□ 3.82
MST1RQ04912 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
MST1RQ04912 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC38.89■■■■□ 3.82
MST1RQ04912 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
MST1RQ04912 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
MST1RQ04912 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC38.85■■■■□ 3.81
MST1RQ04912 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
MST1RQ04912 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.82■■■■□ 3.81
MST1RQ04912 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
MST1RQ04912 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
MST1RQ04912 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
MST1RQ04912 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
MST1RQ04912 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
MST1RQ04912 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
MST1RQ04912 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
MST1RQ04912 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
MST1RQ04912 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC38.74■■■■□ 3.79
MST1RQ04912 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
MST1RQ04912 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
MST1RQ04912 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
MST1RQ04912 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
MST1RQ04912 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
MST1RQ04912 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
MST1RQ04912 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
MST1RQ04912 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
MST1RQ04912 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
MST1RQ04912 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
MST1RQ04912 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
MST1RQ04912 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
MST1RQ04912 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.63■■■■□ 3.78
MST1RQ04912 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC38.58■■■■□ 3.77
MST1RQ04912 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
MST1RQ04912 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.76
MST1RQ04912 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms