Protein–RNA interactions for Protein: Q04724

TLE1, Transducin-like enhancer protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE1Q04724 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TLE1Q04724 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TLE1Q04724 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TLE1Q04724 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TLE1Q04724 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TLE1Q04724 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
TLE1Q04724 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TLE1Q04724 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TLE1Q04724 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TLE1Q04724 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TLE1Q04724 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TLE1Q04724 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TLE1Q04724 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TLE1Q04724 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TLE1Q04724 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TLE1Q04724 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TLE1Q04724 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TLE1Q04724 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TLE1Q04724 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TLE1Q04724 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TLE1Q04724 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TLE1Q04724 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TLE1Q04724 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TLE1Q04724 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TLE1Q04724 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TLE1Q04724 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TLE1Q04724 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TLE1Q04724 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TLE1Q04724 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TLE1Q04724 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TLE1Q04724 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TLE1Q04724 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TLE1Q04724 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TLE1Q04724 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TLE1Q04724 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TLE1Q04724 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TLE1Q04724 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TLE1Q04724 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TLE1Q04724 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TLE1Q04724 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TLE1Q04724 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TLE1Q04724 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TLE1Q04724 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TLE1Q04724 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TLE1Q04724 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TLE1Q04724 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TLE1Q04724 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TLE1Q04724 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TLE1Q04724 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TLE1Q04724 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TLE1Q04724 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TLE1Q04724 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TLE1Q04724 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TLE1Q04724 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TLE1Q04724 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TLE1Q04724 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TLE1Q04724 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TLE1Q04724 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TLE1Q04724 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TLE1Q04724 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TLE1Q04724 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TLE1Q04724 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TLE1Q04724 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TLE1Q04724 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TLE1Q04724 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TLE1Q04724 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TLE1Q04724 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TLE1Q04724 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TLE1Q04724 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TLE1Q04724 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TLE1Q04724 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TLE1Q04724 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TLE1Q04724 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TLE1Q04724 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TLE1Q04724 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TLE1Q04724 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TLE1Q04724 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TLE1Q04724 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TLE1Q04724 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TLE1Q04724 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TLE1Q04724 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TLE1Q04724 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TLE1Q04724 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TLE1Q04724 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TLE1Q04724 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TLE1Q04724 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TLE1Q04724 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TLE1Q04724 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TLE1Q04724 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TLE1Q04724 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TLE1Q04724 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TLE1Q04724 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TLE1Q04724 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TLE1Q04724 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TLE1Q04724 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TLE1Q04724 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TLE1Q04724 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TLE1Q04724 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TLE1Q04724 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TLE1Q04724 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms