Protein–RNA interactions for Protein: Q03518

TAP1, Antigen peptide transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP1Q03518 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TAP1Q03518 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
TAP1Q03518 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TAP1Q03518 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TAP1Q03518 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TAP1Q03518 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TAP1Q03518 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TAP1Q03518 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
TAP1Q03518 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
TAP1Q03518 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TAP1Q03518 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.68■■■□□ 2.5
TAP1Q03518 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TAP1Q03518 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
TAP1Q03518 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TAP1Q03518 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
TAP1Q03518 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
TAP1Q03518 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
TAP1Q03518 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TAP1Q03518 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TAP1Q03518 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
TAP1Q03518 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TAP1Q03518 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TAP1Q03518 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
TAP1Q03518 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TAP1Q03518 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
TAP1Q03518 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
TAP1Q03518 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TAP1Q03518 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
TAP1Q03518 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TAP1Q03518 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TAP1Q03518 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TAP1Q03518 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
TAP1Q03518 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
TAP1Q03518 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TAP1Q03518 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TAP1Q03518 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TAP1Q03518 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TAP1Q03518 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TAP1Q03518 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
TAP1Q03518 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TAP1Q03518 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
TAP1Q03518 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TAP1Q03518 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TAP1Q03518 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TAP1Q03518 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TAP1Q03518 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TAP1Q03518 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TAP1Q03518 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TAP1Q03518 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TAP1Q03518 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TAP1Q03518 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TAP1Q03518 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
TAP1Q03518 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TAP1Q03518 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TAP1Q03518 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TAP1Q03518 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TAP1Q03518 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TAP1Q03518 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TAP1Q03518 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TAP1Q03518 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
TAP1Q03518 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TAP1Q03518 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TAP1Q03518 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TAP1Q03518 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
TAP1Q03518 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TAP1Q03518 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TAP1Q03518 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TAP1Q03518 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
TAP1Q03518 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TAP1Q03518 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TAP1Q03518 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
TAP1Q03518 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TAP1Q03518 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TAP1Q03518 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TAP1Q03518 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TAP1Q03518 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TAP1Q03518 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TAP1Q03518 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
TAP1Q03518 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TAP1Q03518 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TAP1Q03518 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TAP1Q03518 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TAP1Q03518 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TAP1Q03518 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TAP1Q03518 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TAP1Q03518 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TAP1Q03518 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TAP1Q03518 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TAP1Q03518 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TAP1Q03518 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TAP1Q03518 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
TAP1Q03518 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TAP1Q03518 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TAP1Q03518 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TAP1Q03518 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TAP1Q03518 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TAP1Q03518 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TAP1Q03518 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TAP1Q03518 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TAP1Q03518 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms