Protein–RNA interactions for Protein: P60900

PSMA6, Proteasome subunit alpha type-6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA6P60900 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMA6P60900 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMA6P60900 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMA6P60900 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMA6P60900 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMA6P60900 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMA6P60900 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMA6P60900 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMA6P60900 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMA6P60900 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMA6P60900 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMA6P60900 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMA6P60900 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMA6P60900 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMA6P60900 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMA6P60900 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMA6P60900 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMA6P60900 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMA6P60900 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMA6P60900 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PSMA6P60900 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMA6P60900 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMA6P60900 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMA6P60900 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMA6P60900 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMA6P60900 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMA6P60900 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMA6P60900 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMA6P60900 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMA6P60900 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMA6P60900 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMA6P60900 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMA6P60900 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMA6P60900 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMA6P60900 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMA6P60900 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMA6P60900 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMA6P60900 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMA6P60900 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMA6P60900 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMA6P60900 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMA6P60900 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMA6P60900 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMA6P60900 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMA6P60900 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMA6P60900 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMA6P60900 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMA6P60900 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMA6P60900 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMA6P60900 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMA6P60900 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMA6P60900 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMA6P60900 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMA6P60900 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PSMA6P60900 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMA6P60900 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMA6P60900 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMA6P60900 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMA6P60900 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMA6P60900 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMA6P60900 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMA6P60900 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMA6P60900 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMA6P60900 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMA6P60900 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMA6P60900 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMA6P60900 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMA6P60900 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMA6P60900 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMA6P60900 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMA6P60900 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMA6P60900 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMA6P60900 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMA6P60900 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMA6P60900 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMA6P60900 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMA6P60900 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMA6P60900 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMA6P60900 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMA6P60900 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSMA6P60900 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMA6P60900 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMA6P60900 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMA6P60900 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMA6P60900 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMA6P60900 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMA6P60900 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMA6P60900 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMA6P60900 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMA6P60900 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMA6P60900 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMA6P60900 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMA6P60900 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMA6P60900 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMA6P60900 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMA6P60900 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMA6P60900 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMA6P60900 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMA6P60900 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMA6P60900 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms