Protein–RNA interactions for Protein: P57727

TMPRSS3, Transmembrane protease serine 3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS3P57727 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TMPRSS3P57727 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMPRSS3P57727 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMPRSS3P57727 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMPRSS3P57727 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMPRSS3P57727 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMPRSS3P57727 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMPRSS3P57727 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMPRSS3P57727 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMPRSS3P57727 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMPRSS3P57727 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMPRSS3P57727 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMPRSS3P57727 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TMPRSS3P57727 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TMPRSS3P57727 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMPRSS3P57727 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMPRSS3P57727 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMPRSS3P57727 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMPRSS3P57727 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMPRSS3P57727 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMPRSS3P57727 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TMPRSS3P57727 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
TMPRSS3P57727 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMPRSS3P57727 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMPRSS3P57727 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TMPRSS3P57727 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMPRSS3P57727 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMPRSS3P57727 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMPRSS3P57727 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMPRSS3P57727 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMPRSS3P57727 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMPRSS3P57727 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMPRSS3P57727 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMPRSS3P57727 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TMPRSS3P57727 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMPRSS3P57727 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMPRSS3P57727 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMPRSS3P57727 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMPRSS3P57727 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMPRSS3P57727 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMPRSS3P57727 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMPRSS3P57727 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMPRSS3P57727 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMPRSS3P57727 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMPRSS3P57727 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMPRSS3P57727 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMPRSS3P57727 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMPRSS3P57727 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TMPRSS3P57727 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TMPRSS3P57727 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMPRSS3P57727 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMPRSS3P57727 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMPRSS3P57727 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMPRSS3P57727 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMPRSS3P57727 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMPRSS3P57727 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMPRSS3P57727 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMPRSS3P57727 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMPRSS3P57727 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TMPRSS3P57727 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMPRSS3P57727 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMPRSS3P57727 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMPRSS3P57727 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMPRSS3P57727 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMPRSS3P57727 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMPRSS3P57727 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMPRSS3P57727 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMPRSS3P57727 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMPRSS3P57727 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMPRSS3P57727 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMPRSS3P57727 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMPRSS3P57727 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMPRSS3P57727 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMPRSS3P57727 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMPRSS3P57727 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMPRSS3P57727 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMPRSS3P57727 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMPRSS3P57727 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMPRSS3P57727 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMPRSS3P57727 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMPRSS3P57727 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMPRSS3P57727 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMPRSS3P57727 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMPRSS3P57727 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMPRSS3P57727 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMPRSS3P57727 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMPRSS3P57727 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMPRSS3P57727 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMPRSS3P57727 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMPRSS3P57727 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMPRSS3P57727 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMPRSS3P57727 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMPRSS3P57727 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TMPRSS3P57727 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMPRSS3P57727 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMPRSS3P57727 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMPRSS3P57727 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMPRSS3P57727 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMPRSS3P57727 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMPRSS3P57727 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms