Protein–RNA interactions for Protein: P56556

NDUFA6, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA6P56556 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDUFA6P56556 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDUFA6P56556 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDUFA6P56556 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDUFA6P56556 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDUFA6P56556 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDUFA6P56556 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDUFA6P56556 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDUFA6P56556 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDUFA6P56556 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDUFA6P56556 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDUFA6P56556 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDUFA6P56556 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDUFA6P56556 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDUFA6P56556 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDUFA6P56556 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDUFA6P56556 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDUFA6P56556 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NDUFA6P56556 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDUFA6P56556 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDUFA6P56556 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFA6P56556 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFA6P56556 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFA6P56556 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFA6P56556 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFA6P56556 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFA6P56556 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFA6P56556 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFA6P56556 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFA6P56556 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFA6P56556 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFA6P56556 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFA6P56556 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFA6P56556 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFA6P56556 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFA6P56556 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFA6P56556 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFA6P56556 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFA6P56556 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDUFA6P56556 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFA6P56556 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFA6P56556 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDUFA6P56556 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFA6P56556 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NDUFA6P56556 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NDUFA6P56556 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFA6P56556 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFA6P56556 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFA6P56556 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDUFA6P56556 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFA6P56556 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFA6P56556 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFA6P56556 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NDUFA6P56556 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFA6P56556 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFA6P56556 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFA6P56556 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDUFA6P56556 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDUFA6P56556 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDUFA6P56556 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDUFA6P56556 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDUFA6P56556 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDUFA6P56556 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDUFA6P56556 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NDUFA6P56556 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NDUFA6P56556 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NDUFA6P56556 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NDUFA6P56556 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NDUFA6P56556 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NDUFA6P56556 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDUFA6P56556 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NDUFA6P56556 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NDUFA6P56556 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NDUFA6P56556 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NDUFA6P56556 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NDUFA6P56556 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NDUFA6P56556 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NDUFA6P56556 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NDUFA6P56556 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NDUFA6P56556 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NDUFA6P56556 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDUFA6P56556 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDUFA6P56556 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDUFA6P56556 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDUFA6P56556 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NDUFA6P56556 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NDUFA6P56556 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDUFA6P56556 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDUFA6P56556 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NDUFA6P56556 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NDUFA6P56556 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NDUFA6P56556 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NDUFA6P56556 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NDUFA6P56556 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NDUFA6P56556 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NDUFA6P56556 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NDUFA6P56556 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NDUFA6P56556 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NDUFA6P56556 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NDUFA6P56556 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms