Protein–RNA interactions for Protein: P54829

PTPN5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN5P54829 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPN5P54829 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPN5P54829 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPN5P54829 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPN5P54829 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPN5P54829 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPN5P54829 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPN5P54829 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPN5P54829 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PTPN5P54829 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPN5P54829 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPN5P54829 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPN5P54829 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPN5P54829 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPN5P54829 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPN5P54829 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPN5P54829 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPN5P54829 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPN5P54829 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPN5P54829 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPN5P54829 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPN5P54829 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPN5P54829 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PTPN5P54829 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTPN5P54829 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPN5P54829 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPN5P54829 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPN5P54829 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPN5P54829 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPN5P54829 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
PTPN5P54829 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTPN5P54829 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPN5P54829 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPN5P54829 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPN5P54829 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPN5P54829 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPN5P54829 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPN5P54829 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPN5P54829 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPN5P54829 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPN5P54829 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPN5P54829 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPN5P54829 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPN5P54829 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPN5P54829 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPN5P54829 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPN5P54829 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPN5P54829 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPN5P54829 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPN5P54829 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPN5P54829 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPN5P54829 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPN5P54829 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPN5P54829 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPN5P54829 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPN5P54829 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPN5P54829 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPN5P54829 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPN5P54829 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPN5P54829 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPN5P54829 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPN5P54829 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPN5P54829 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPN5P54829 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPN5P54829 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPN5P54829 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPN5P54829 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PTPN5P54829 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPN5P54829 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPN5P54829 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPN5P54829 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPN5P54829 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPN5P54829 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPN5P54829 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPN5P54829 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPN5P54829 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPN5P54829 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPN5P54829 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPN5P54829 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPN5P54829 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPN5P54829 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPN5P54829 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPN5P54829 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPN5P54829 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPN5P54829 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPN5P54829 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPN5P54829 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPN5P54829 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPN5P54829 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPN5P54829 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPN5P54829 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPN5P54829 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPN5P54829 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPN5P54829 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPN5P54829 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPN5P54829 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPN5P54829 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPN5P54829 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPN5P54829 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPN5P54829 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms