Protein–RNA interactions for Protein: P51610

HCFC1, Host cell factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCFC1P51610 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HCFC1P51610 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HCFC1P51610 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HCFC1P51610 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HCFC1P51610 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HCFC1P51610 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HCFC1P51610 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HCFC1P51610 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HCFC1P51610 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HCFC1P51610 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HCFC1P51610 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HCFC1P51610 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HCFC1P51610 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HCFC1P51610 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HCFC1P51610 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HCFC1P51610 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HCFC1P51610 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HCFC1P51610 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HCFC1P51610 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HCFC1P51610 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HCFC1P51610 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HCFC1P51610 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HCFC1P51610 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HCFC1P51610 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HCFC1P51610 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HCFC1P51610 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HCFC1P51610 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HCFC1P51610 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HCFC1P51610 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HCFC1P51610 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HCFC1P51610 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HCFC1P51610 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HCFC1P51610 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HCFC1P51610 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HCFC1P51610 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HCFC1P51610 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HCFC1P51610 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HCFC1P51610 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HCFC1P51610 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HCFC1P51610 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HCFC1P51610 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HCFC1P51610 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HCFC1P51610 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HCFC1P51610 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HCFC1P51610 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HCFC1P51610 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HCFC1P51610 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HCFC1P51610 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HCFC1P51610 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HCFC1P51610 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HCFC1P51610 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HCFC1P51610 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HCFC1P51610 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HCFC1P51610 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HCFC1P51610 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HCFC1P51610 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HCFC1P51610 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HCFC1P51610 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HCFC1P51610 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HCFC1P51610 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HCFC1P51610 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HCFC1P51610 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HCFC1P51610 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HCFC1P51610 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HCFC1P51610 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HCFC1P51610 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HCFC1P51610 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HCFC1P51610 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HCFC1P51610 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HCFC1P51610 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HCFC1P51610 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HCFC1P51610 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HCFC1P51610 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HCFC1P51610 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HCFC1P51610 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HCFC1P51610 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HCFC1P51610 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HCFC1P51610 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HCFC1P51610 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HCFC1P51610 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HCFC1P51610 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HCFC1P51610 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HCFC1P51610 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HCFC1P51610 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HCFC1P51610 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HCFC1P51610 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HCFC1P51610 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HCFC1P51610 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HCFC1P51610 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HCFC1P51610 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HCFC1P51610 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HCFC1P51610 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HCFC1P51610 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HCFC1P51610 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HCFC1P51610 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HCFC1P51610 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HCFC1P51610 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HCFC1P51610 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HCFC1P51610 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HCFC1P51610 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms