Protein–RNA interactions for Protein: P41732

TSPAN7, Tetraspanin-7, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN7P41732 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TSPAN7P41732 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TSPAN7P41732 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSPAN7P41732 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSPAN7P41732 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TSPAN7P41732 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TSPAN7P41732 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TSPAN7P41732 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TSPAN7P41732 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TSPAN7P41732 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TSPAN7P41732 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TSPAN7P41732 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSPAN7P41732 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TSPAN7P41732 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TSPAN7P41732 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSPAN7P41732 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TSPAN7P41732 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TSPAN7P41732 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSPAN7P41732 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSPAN7P41732 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSPAN7P41732 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TSPAN7P41732 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TSPAN7P41732 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSPAN7P41732 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TSPAN7P41732 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TSPAN7P41732 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TSPAN7P41732 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TSPAN7P41732 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TSPAN7P41732 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TSPAN7P41732 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TSPAN7P41732 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TSPAN7P41732 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TSPAN7P41732 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TSPAN7P41732 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TSPAN7P41732 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TSPAN7P41732 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TSPAN7P41732 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TSPAN7P41732 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TSPAN7P41732 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TSPAN7P41732 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TSPAN7P41732 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TSPAN7P41732 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TSPAN7P41732 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TSPAN7P41732 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TSPAN7P41732 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TSPAN7P41732 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TSPAN7P41732 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TSPAN7P41732 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TSPAN7P41732 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TSPAN7P41732 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TSPAN7P41732 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TSPAN7P41732 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TSPAN7P41732 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TSPAN7P41732 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TSPAN7P41732 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TSPAN7P41732 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TSPAN7P41732 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TSPAN7P41732 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TSPAN7P41732 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TSPAN7P41732 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TSPAN7P41732 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSPAN7P41732 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TSPAN7P41732 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSPAN7P41732 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSPAN7P41732 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TSPAN7P41732 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSPAN7P41732 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSPAN7P41732 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSPAN7P41732 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSPAN7P41732 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSPAN7P41732 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSPAN7P41732 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSPAN7P41732 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TSPAN7P41732 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
TSPAN7P41732 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TSPAN7P41732 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TSPAN7P41732 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TSPAN7P41732 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TSPAN7P41732 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TSPAN7P41732 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TSPAN7P41732 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TSPAN7P41732 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSPAN7P41732 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSPAN7P41732 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TSPAN7P41732 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TSPAN7P41732 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TSPAN7P41732 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TSPAN7P41732 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TSPAN7P41732 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSPAN7P41732 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSPAN7P41732 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSPAN7P41732 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSPAN7P41732 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSPAN7P41732 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSPAN7P41732 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSPAN7P41732 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSPAN7P41732 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSPAN7P41732 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TSPAN7P41732 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSPAN7P41732 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms