Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP6V1E1P36543 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP6V1E1P36543 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP6V1E1P36543 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP6V1E1P36543 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP6V1E1P36543 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP6V1E1P36543 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP6V1E1P36543 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP6V1E1P36543 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP6V1E1P36543 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP6V1E1P36543 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP6V1E1P36543 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ATP6V1E1P36543 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP6V1E1P36543 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP6V1E1P36543 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP6V1E1P36543 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP6V1E1P36543 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP6V1E1P36543 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP6V1E1P36543 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP6V1E1P36543 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP6V1E1P36543 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP6V1E1P36543 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP6V1E1P36543 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP6V1E1P36543 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP6V1E1P36543 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP6V1E1P36543 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP6V1E1P36543 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP6V1E1P36543 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP6V1E1P36543 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP6V1E1P36543 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP6V1E1P36543 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP6V1E1P36543 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP6V1E1P36543 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP6V1E1P36543 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP6V1E1P36543 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP6V1E1P36543 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP6V1E1P36543 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP6V1E1P36543 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP6V1E1P36543 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP6V1E1P36543 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP6V1E1P36543 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP6V1E1P36543 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP6V1E1P36543 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP6V1E1P36543 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP6V1E1P36543 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP6V1E1P36543 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP6V1E1P36543 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP6V1E1P36543 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP6V1E1P36543 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP6V1E1P36543 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP6V1E1P36543 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP6V1E1P36543 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP6V1E1P36543 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP6V1E1P36543 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP6V1E1P36543 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP6V1E1P36543 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP6V1E1P36543 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP6V1E1P36543 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP6V1E1P36543 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP6V1E1P36543 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP6V1E1P36543 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATP6V1E1P36543 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP6V1E1P36543 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP6V1E1P36543 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP6V1E1P36543 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP6V1E1P36543 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP6V1E1P36543 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP6V1E1P36543 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP6V1E1P36543 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP6V1E1P36543 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP6V1E1P36543 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP6V1E1P36543 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP6V1E1P36543 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP6V1E1P36543 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP6V1E1P36543 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP6V1E1P36543 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP6V1E1P36543 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP6V1E1P36543 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP6V1E1P36543 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP6V1E1P36543 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP6V1E1P36543 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP6V1E1P36543 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP6V1E1P36543 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP6V1E1P36543 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP6V1E1P36543 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP6V1E1P36543 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP6V1E1P36543 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP6V1E1P36543 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP6V1E1P36543 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP6V1E1P36543 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP6V1E1P36543 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP6V1E1P36543 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP6V1E1P36543 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP6V1E1P36543 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP6V1E1P36543 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP6V1E1P36543 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP6V1E1P36543 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP6V1E1P36543 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP6V1E1P36543 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP6V1E1P36543 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms