Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
VEGFAP15692 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
VEGFAP15692 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
VEGFAP15692 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
VEGFAP15692 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
VEGFAP15692 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
VEGFAP15692 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
VEGFAP15692 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
VEGFAP15692 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
VEGFAP15692 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
VEGFAP15692 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
VEGFAP15692 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
VEGFAP15692 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
VEGFAP15692 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
VEGFAP15692 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
VEGFAP15692 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
VEGFAP15692 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
VEGFAP15692 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
VEGFAP15692 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
VEGFAP15692 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
VEGFAP15692 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
VEGFAP15692 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
VEGFAP15692 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
VEGFAP15692 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
VEGFAP15692 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
VEGFAP15692 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
VEGFAP15692 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
VEGFAP15692 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
VEGFAP15692 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
VEGFAP15692 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
VEGFAP15692 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
VEGFAP15692 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
VEGFAP15692 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
VEGFAP15692 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
VEGFAP15692 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
VEGFAP15692 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
VEGFAP15692 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
VEGFAP15692 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
VEGFAP15692 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
VEGFAP15692 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
VEGFAP15692 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
VEGFAP15692 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
VEGFAP15692 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
VEGFAP15692 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
VEGFAP15692 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
VEGFAP15692 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
VEGFAP15692 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
VEGFAP15692 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
VEGFAP15692 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.22■■■■□ 3.07
VEGFAP15692 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
VEGFAP15692 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
VEGFAP15692 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
VEGFAP15692 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
VEGFAP15692 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
VEGFAP15692 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
VEGFAP15692 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
VEGFAP15692 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
VEGFAP15692 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
VEGFAP15692 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
VEGFAP15692 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
VEGFAP15692 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
VEGFAP15692 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
VEGFAP15692 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
VEGFAP15692 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
VEGFAP15692 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
VEGFAP15692 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
VEGFAP15692 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
VEGFAP15692 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
VEGFAP15692 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
VEGFAP15692 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
VEGFAP15692 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
VEGFAP15692 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
VEGFAP15692 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
VEGFAP15692 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
VEGFAP15692 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
VEGFAP15692 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
VEGFAP15692 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
VEGFAP15692 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
VEGFAP15692 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
VEGFAP15692 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
VEGFAP15692 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
VEGFAP15692 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
VEGFAP15692 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
VEGFAP15692 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC33.96■■■■□ 3.03
VEGFAP15692 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
VEGFAP15692 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
VEGFAP15692 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
VEGFAP15692 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
VEGFAP15692 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
VEGFAP15692 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
VEGFAP15692 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
VEGFAP15692 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
VEGFAP15692 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
VEGFAP15692 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
VEGFAP15692 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
VEGFAP15692 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
VEGFAP15692 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
VEGFAP15692 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
VEGFAP15692 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
VEGFAP15692 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms