Protein–RNA interactions for Protein: P14652

HOXB2, Homeobox protein Hox-B2, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB2P14652 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
HOXB2P14652 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HOXB2P14652 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HOXB2P14652 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HOXB2P14652 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HOXB2P14652 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HOXB2P14652 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HOXB2P14652 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HOXB2P14652 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
HOXB2P14652 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HOXB2P14652 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HOXB2P14652 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HOXB2P14652 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HOXB2P14652 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HOXB2P14652 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HOXB2P14652 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HOXB2P14652 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HOXB2P14652 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HOXB2P14652 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HOXB2P14652 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HOXB2P14652 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXB2P14652 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HOXB2P14652 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXB2P14652 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXB2P14652 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
HOXB2P14652 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HOXB2P14652 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
HOXB2P14652 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HOXB2P14652 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HOXB2P14652 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXB2P14652 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXB2P14652 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXB2P14652 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXB2P14652 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXB2P14652 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXB2P14652 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXB2P14652 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
HOXB2P14652 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HOXB2P14652 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HOXB2P14652 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HOXB2P14652 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HOXB2P14652 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HOXB2P14652 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXB2P14652 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HOXB2P14652 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXB2P14652 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXB2P14652 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXB2P14652 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXB2P14652 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXB2P14652 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXB2P14652 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXB2P14652 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXB2P14652 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXB2P14652 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXB2P14652 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXB2P14652 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HOXB2P14652 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXB2P14652 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXB2P14652 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXB2P14652 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXB2P14652 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HOXB2P14652 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXB2P14652 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXB2P14652 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXB2P14652 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXB2P14652 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXB2P14652 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXB2P14652 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXB2P14652 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXB2P14652 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXB2P14652 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXB2P14652 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXB2P14652 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXB2P14652 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXB2P14652 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXB2P14652 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXB2P14652 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXB2P14652 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
HOXB2P14652 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
HOXB2P14652 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXB2P14652 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HOXB2P14652 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXB2P14652 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXB2P14652 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXB2P14652 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXB2P14652 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXB2P14652 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HOXB2P14652 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
HOXB2P14652 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXB2P14652 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXB2P14652 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXB2P14652 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXB2P14652 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HOXB2P14652 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HOXB2P14652 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HOXB2P14652 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXB2P14652 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXB2P14652 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXB2P14652 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXB2P14652 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms