Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
GLI3P10071 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
GLI3P10071 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
GLI3P10071 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
GLI3P10071 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
GLI3P10071 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
GLI3P10071 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
GLI3P10071 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
GLI3P10071 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
GLI3P10071 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC38.14■■■■□ 3.7
GLI3P10071 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
GLI3P10071 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
GLI3P10071 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
GLI3P10071 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
GLI3P10071 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
GLI3P10071 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
GLI3P10071 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
GLI3P10071 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC38.04■■■■□ 3.68
GLI3P10071 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
GLI3P10071 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
GLI3P10071 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
GLI3P10071 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
GLI3P10071 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
GLI3P10071 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC37.99■■■■□ 3.67
GLI3P10071 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
GLI3P10071 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
GLI3P10071 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
GLI3P10071 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
GLI3P10071 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
GLI3P10071 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
GLI3P10071 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
GLI3P10071 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
GLI3P10071 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
GLI3P10071 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
GLI3P10071 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
GLI3P10071 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
GLI3P10071 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
GLI3P10071 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC37.8■■■■□ 3.64
GLI3P10071 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
GLI3P10071 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
GLI3P10071 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
GLI3P10071 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
GLI3P10071 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
GLI3P10071 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
GLI3P10071 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
GLI3P10071 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
GLI3P10071 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
GLI3P10071 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
GLI3P10071 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
GLI3P10071 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
GLI3P10071 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
GLI3P10071 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
GLI3P10071 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
GLI3P10071 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
GLI3P10071 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
GLI3P10071 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
GLI3P10071 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.68■■■■□ 3.62
GLI3P10071 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
GLI3P10071 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
GLI3P10071 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
GLI3P10071 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
GLI3P10071 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
GLI3P10071 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.62
GLI3P10071 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
GLI3P10071 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
GLI3P10071 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
GLI3P10071 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
GLI3P10071 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
GLI3P10071 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
GLI3P10071 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC37.53■■■■□ 3.6
GLI3P10071 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
GLI3P10071 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
GLI3P10071 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
GLI3P10071 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.59
GLI3P10071 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.59
GLI3P10071 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
GLI3P10071 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
GLI3P10071 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
GLI3P10071 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
GLI3P10071 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
GLI3P10071 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC37.45■■■■□ 3.59
GLI3P10071 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
GLI3P10071 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
GLI3P10071 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
GLI3P10071 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
GLI3P10071 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
GLI3P10071 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC37.35■■■■□ 3.57
GLI3P10071 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC37.35■■■■□ 3.57
GLI3P10071 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
GLI3P10071 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
GLI3P10071 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
GLI3P10071 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
GLI3P10071 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
GLI3P10071 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
GLI3P10071 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC37.29■■■■□ 3.56
GLI3P10071 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
GLI3P10071 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
GLI3P10071 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
GLI3P10071 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
GLI3P10071 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.1 ms