Protein–RNA interactions for Protein: P0DP07

IGHV4-31, Immunoglobulin heavy variable 4-31, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV4-31P0DP07 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGHV4-31P0DP07 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGHV4-31P0DP07 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGHV4-31P0DP07 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGHV4-31P0DP07 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGHV4-31P0DP07 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGHV4-31P0DP07 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGHV4-31P0DP07 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGHV4-31P0DP07 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGHV4-31P0DP07 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGHV4-31P0DP07 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGHV4-31P0DP07 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
IGHV4-31P0DP07 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGHV4-31P0DP07 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGHV4-31P0DP07 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGHV4-31P0DP07 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGHV4-31P0DP07 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGHV4-31P0DP07 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGHV4-31P0DP07 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGHV4-31P0DP07 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGHV4-31P0DP07 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGHV4-31P0DP07 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGHV4-31P0DP07 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGHV4-31P0DP07 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGHV4-31P0DP07 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGHV4-31P0DP07 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IGHV4-31P0DP07 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGHV4-31P0DP07 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGHV4-31P0DP07 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
IGHV4-31P0DP07 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGHV4-31P0DP07 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGHV4-31P0DP07 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGHV4-31P0DP07 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGHV4-31P0DP07 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGHV4-31P0DP07 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGHV4-31P0DP07 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IGHV4-31P0DP07 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGHV4-31P0DP07 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGHV4-31P0DP07 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGHV4-31P0DP07 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGHV4-31P0DP07 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGHV4-31P0DP07 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGHV4-31P0DP07 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
IGHV4-31P0DP07 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGHV4-31P0DP07 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGHV4-31P0DP07 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGHV4-31P0DP07 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGHV4-31P0DP07 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGHV4-31P0DP07 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
IGHV4-31P0DP07 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
IGHV4-31P0DP07 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGHV4-31P0DP07 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGHV4-31P0DP07 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGHV4-31P0DP07 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGHV4-31P0DP07 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGHV4-31P0DP07 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGHV4-31P0DP07 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGHV4-31P0DP07 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IGHV4-31P0DP07 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGHV4-31P0DP07 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IGHV4-31P0DP07 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGHV4-31P0DP07 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGHV4-31P0DP07 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGHV4-31P0DP07 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGHV4-31P0DP07 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGHV4-31P0DP07 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGHV4-31P0DP07 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
IGHV4-31P0DP07 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
IGHV4-31P0DP07 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGHV4-31P0DP07 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGHV4-31P0DP07 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGHV4-31P0DP07 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGHV4-31P0DP07 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGHV4-31P0DP07 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGHV4-31P0DP07 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGHV4-31P0DP07 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGHV4-31P0DP07 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGHV4-31P0DP07 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGHV4-31P0DP07 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGHV4-31P0DP07 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGHV4-31P0DP07 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGHV4-31P0DP07 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGHV4-31P0DP07 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHV4-31P0DP07 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHV4-31P0DP07 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHV4-31P0DP07 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHV4-31P0DP07 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHV4-31P0DP07 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHV4-31P0DP07 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHV4-31P0DP07 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHV4-31P0DP07 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGHV4-31P0DP07 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGHV4-31P0DP07 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGHV4-31P0DP07 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
IGHV4-31P0DP07 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGHV4-31P0DP07 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
IGHV4-31P0DP07 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGHV4-31P0DP07 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGHV4-31P0DP07 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGHV4-31P0DP07 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms