Protein–RNA interactions for Protein: P0DH78

RNF224, RING finger protein 224, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF224P0DH78 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF224P0DH78 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF224P0DH78 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF224P0DH78 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF224P0DH78 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF224P0DH78 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF224P0DH78 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF224P0DH78 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF224P0DH78 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF224P0DH78 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF224P0DH78 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF224P0DH78 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF224P0DH78 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF224P0DH78 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF224P0DH78 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF224P0DH78 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF224P0DH78 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF224P0DH78 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF224P0DH78 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF224P0DH78 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF224P0DH78 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF224P0DH78 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF224P0DH78 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF224P0DH78 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF224P0DH78 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF224P0DH78 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF224P0DH78 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF224P0DH78 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF224P0DH78 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF224P0DH78 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF224P0DH78 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF224P0DH78 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF224P0DH78 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF224P0DH78 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF224P0DH78 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF224P0DH78 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF224P0DH78 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF224P0DH78 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF224P0DH78 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF224P0DH78 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF224P0DH78 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF224P0DH78 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF224P0DH78 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF224P0DH78 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF224P0DH78 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF224P0DH78 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF224P0DH78 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF224P0DH78 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF224P0DH78 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF224P0DH78 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF224P0DH78 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF224P0DH78 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF224P0DH78 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF224P0DH78 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF224P0DH78 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF224P0DH78 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF224P0DH78 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF224P0DH78 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF224P0DH78 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF224P0DH78 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF224P0DH78 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF224P0DH78 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF224P0DH78 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF224P0DH78 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF224P0DH78 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF224P0DH78 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF224P0DH78 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF224P0DH78 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF224P0DH78 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF224P0DH78 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF224P0DH78 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF224P0DH78 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF224P0DH78 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF224P0DH78 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF224P0DH78 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF224P0DH78 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF224P0DH78 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF224P0DH78 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF224P0DH78 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF224P0DH78 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF224P0DH78 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF224P0DH78 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF224P0DH78 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF224P0DH78 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF224P0DH78 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF224P0DH78 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF224P0DH78 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RNF224P0DH78 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RNF224P0DH78 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF224P0DH78 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF224P0DH78 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF224P0DH78 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF224P0DH78 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF224P0DH78 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF224P0DH78 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF224P0DH78 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF224P0DH78 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF224P0DH78 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF224P0DH78 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF224P0DH78 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms