Protein–RNA interactions for Protein: P0C5Y9

H2AFB1, Histone H2A-Bbd type 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFB1P0C5Y9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2AFB1P0C5Y9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2AFB1P0C5Y9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2AFB1P0C5Y9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2AFB1P0C5Y9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2AFB1P0C5Y9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2AFB1P0C5Y9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2AFB1P0C5Y9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2AFB1P0C5Y9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2AFB1P0C5Y9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
H2AFB1P0C5Y9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2AFB1P0C5Y9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2AFB1P0C5Y9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2AFB1P0C5Y9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2AFB1P0C5Y9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2AFB1P0C5Y9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2AFB1P0C5Y9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2AFB1P0C5Y9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2AFB1P0C5Y9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2AFB1P0C5Y9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2AFB1P0C5Y9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2AFB1P0C5Y9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
H2AFB1P0C5Y9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2AFB1P0C5Y9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2AFB1P0C5Y9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2AFB1P0C5Y9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2AFB1P0C5Y9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2AFB1P0C5Y9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2AFB1P0C5Y9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2AFB1P0C5Y9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2AFB1P0C5Y9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2AFB1P0C5Y9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2AFB1P0C5Y9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2AFB1P0C5Y9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2AFB1P0C5Y9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2AFB1P0C5Y9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2AFB1P0C5Y9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
H2AFB1P0C5Y9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2AFB1P0C5Y9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2AFB1P0C5Y9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2AFB1P0C5Y9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2AFB1P0C5Y9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2AFB1P0C5Y9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
H2AFB1P0C5Y9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
H2AFB1P0C5Y9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2AFB1P0C5Y9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2AFB1P0C5Y9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2AFB1P0C5Y9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2AFB1P0C5Y9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2AFB1P0C5Y9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2AFB1P0C5Y9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2AFB1P0C5Y9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2AFB1P0C5Y9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2AFB1P0C5Y9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2AFB1P0C5Y9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFB1P0C5Y9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFB1P0C5Y9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFB1P0C5Y9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFB1P0C5Y9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2AFB1P0C5Y9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2AFB1P0C5Y9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2AFB1P0C5Y9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2AFB1P0C5Y9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2AFB1P0C5Y9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2AFB1P0C5Y9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2AFB1P0C5Y9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2AFB1P0C5Y9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2AFB1P0C5Y9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2AFB1P0C5Y9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFB1P0C5Y9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFB1P0C5Y9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2AFB1P0C5Y9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2AFB1P0C5Y9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2AFB1P0C5Y9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2AFB1P0C5Y9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2AFB1P0C5Y9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2AFB1P0C5Y9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2AFB1P0C5Y9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2AFB1P0C5Y9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2AFB1P0C5Y9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2AFB1P0C5Y9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2AFB1P0C5Y9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2AFB1P0C5Y9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2AFB1P0C5Y9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
H2AFB1P0C5Y9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
H2AFB1P0C5Y9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2AFB1P0C5Y9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2AFB1P0C5Y9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2AFB1P0C5Y9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2AFB1P0C5Y9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2AFB1P0C5Y9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2AFB1P0C5Y9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2AFB1P0C5Y9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2AFB1P0C5Y9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2AFB1P0C5Y9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2AFB1P0C5Y9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2AFB1P0C5Y9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2AFB1P0C5Y9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2AFB1P0C5Y9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2AFB1P0C5Y9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms