Protein–RNA interactions for Protein: P01011

SERPINA3, Alpha-1-antichymotrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA3P01011 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SERPINA3P01011 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SERPINA3P01011 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SERPINA3P01011 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SERPINA3P01011 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SERPINA3P01011 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SERPINA3P01011 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SERPINA3P01011 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SERPINA3P01011 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SERPINA3P01011 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SERPINA3P01011 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SERPINA3P01011 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SERPINA3P01011 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SERPINA3P01011 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SERPINA3P01011 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SERPINA3P01011 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SERPINA3P01011 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SERPINA3P01011 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SERPINA3P01011 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SERPINA3P01011 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SERPINA3P01011 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SERPINA3P01011 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SERPINA3P01011 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SERPINA3P01011 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SERPINA3P01011 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SERPINA3P01011 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SERPINA3P01011 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SERPINA3P01011 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SERPINA3P01011 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SERPINA3P01011 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SERPINA3P01011 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SERPINA3P01011 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SERPINA3P01011 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SERPINA3P01011 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SERPINA3P01011 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SERPINA3P01011 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SERPINA3P01011 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SERPINA3P01011 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SERPINA3P01011 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SERPINA3P01011 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SERPINA3P01011 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SERPINA3P01011 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SERPINA3P01011 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SERPINA3P01011 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SERPINA3P01011 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SERPINA3P01011 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SERPINA3P01011 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SERPINA3P01011 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SERPINA3P01011 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SERPINA3P01011 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SERPINA3P01011 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SERPINA3P01011 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SERPINA3P01011 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SERPINA3P01011 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SERPINA3P01011 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SERPINA3P01011 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SERPINA3P01011 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SERPINA3P01011 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SERPINA3P01011 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SERPINA3P01011 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SERPINA3P01011 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SERPINA3P01011 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SERPINA3P01011 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SERPINA3P01011 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SERPINA3P01011 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SERPINA3P01011 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SERPINA3P01011 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SERPINA3P01011 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SERPINA3P01011 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SERPINA3P01011 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SERPINA3P01011 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SERPINA3P01011 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SERPINA3P01011 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SERPINA3P01011 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SERPINA3P01011 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SERPINA3P01011 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SERPINA3P01011 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SERPINA3P01011 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SERPINA3P01011 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SERPINA3P01011 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SERPINA3P01011 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SERPINA3P01011 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SERPINA3P01011 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SERPINA3P01011 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SERPINA3P01011 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SERPINA3P01011 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SERPINA3P01011 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SERPINA3P01011 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SERPINA3P01011 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SERPINA3P01011 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SERPINA3P01011 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SERPINA3P01011 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SERPINA3P01011 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SERPINA3P01011 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SERPINA3P01011 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SERPINA3P01011 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SERPINA3P01011 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SERPINA3P01011 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SERPINA3P01011 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SERPINA3P01011 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms