Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
USP19O94966 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
USP19O94966 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
USP19O94966 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
USP19O94966 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
USP19O94966 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
USP19O94966 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
USP19O94966 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
USP19O94966 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
USP19O94966 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.73
USP19O94966 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
USP19O94966 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC38.33■■■■□ 3.73
USP19O94966 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.73
USP19O94966 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
USP19O94966 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
USP19O94966 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC38.28■■■■□ 3.72
USP19O94966 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
USP19O94966 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
USP19O94966 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
USP19O94966 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
USP19O94966 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
USP19O94966 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC38.13■■■■□ 3.7
USP19O94966 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
USP19O94966 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
USP19O94966 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
USP19O94966 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
USP19O94966 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
USP19O94966 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
USP19O94966 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
USP19O94966 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
USP19O94966 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
USP19O94966 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.04■■■■□ 3.68
USP19O94966 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
USP19O94966 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
USP19O94966 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC37.99■■■■□ 3.67
USP19O94966 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
USP19O94966 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
USP19O94966 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
USP19O94966 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
USP19O94966 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
USP19O94966 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
USP19O94966 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
USP19O94966 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
USP19O94966 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
USP19O94966 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
USP19O94966 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
USP19O94966 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
USP19O94966 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
USP19O94966 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.66
USP19O94966 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
USP19O94966 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
USP19O94966 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
USP19O94966 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
USP19O94966 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
USP19O94966 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
USP19O94966 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
USP19O94966 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
USP19O94966 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
USP19O94966 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
USP19O94966 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
USP19O94966 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
USP19O94966 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
USP19O94966 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
USP19O94966 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
USP19O94966 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
USP19O94966 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
USP19O94966 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
USP19O94966 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
USP19O94966 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
USP19O94966 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
USP19O94966 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
USP19O94966 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
USP19O94966 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
USP19O94966 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
USP19O94966 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
USP19O94966 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
USP19O94966 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
USP19O94966 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
USP19O94966 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
USP19O94966 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.62
USP19O94966 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
USP19O94966 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
USP19O94966 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
USP19O94966 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
USP19O94966 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
USP19O94966 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
USP19O94966 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC37.54■■■■□ 3.6
USP19O94966 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
USP19O94966 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
USP19O94966 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
USP19O94966 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.6
USP19O94966 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
USP19O94966 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC37.51■■■■□ 3.59
USP19O94966 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
USP19O94966 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
USP19O94966 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
USP19O94966 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
USP19O94966 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
USP19O94966 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
USP19O94966 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms