Protein–RNA interactions for Protein: O60506

SYNCRIP, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCRIPO60506 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYNCRIPO60506 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYNCRIPO60506 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYNCRIPO60506 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYNCRIPO60506 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYNCRIPO60506 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNCRIPO60506 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYNCRIPO60506 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYNCRIPO60506 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYNCRIPO60506 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYNCRIPO60506 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYNCRIPO60506 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYNCRIPO60506 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYNCRIPO60506 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYNCRIPO60506 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYNCRIPO60506 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYNCRIPO60506 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYNCRIPO60506 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYNCRIPO60506 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYNCRIPO60506 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYNCRIPO60506 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYNCRIPO60506 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYNCRIPO60506 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYNCRIPO60506 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYNCRIPO60506 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYNCRIPO60506 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SYNCRIPO60506 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYNCRIPO60506 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SYNCRIPO60506 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYNCRIPO60506 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYNCRIPO60506 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYNCRIPO60506 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYNCRIPO60506 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SYNCRIPO60506 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SYNCRIPO60506 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYNCRIPO60506 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYNCRIPO60506 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYNCRIPO60506 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SYNCRIPO60506 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYNCRIPO60506 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYNCRIPO60506 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYNCRIPO60506 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNCRIPO60506 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYNCRIPO60506 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYNCRIPO60506 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
SYNCRIPO60506 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNCRIPO60506 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYNCRIPO60506 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYNCRIPO60506 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYNCRIPO60506 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SYNCRIPO60506 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYNCRIPO60506 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYNCRIPO60506 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNCRIPO60506 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYNCRIPO60506 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYNCRIPO60506 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYNCRIPO60506 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SYNCRIPO60506 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SYNCRIPO60506 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYNCRIPO60506 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SYNCRIPO60506 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYNCRIPO60506 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYNCRIPO60506 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYNCRIPO60506 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNCRIPO60506 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNCRIPO60506 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNCRIPO60506 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNCRIPO60506 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYNCRIPO60506 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYNCRIPO60506 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYNCRIPO60506 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYNCRIPO60506 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNCRIPO60506 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNCRIPO60506 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNCRIPO60506 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNCRIPO60506 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNCRIPO60506 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNCRIPO60506 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNCRIPO60506 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNCRIPO60506 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYNCRIPO60506 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYNCRIPO60506 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYNCRIPO60506 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYNCRIPO60506 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYNCRIPO60506 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYNCRIPO60506 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYNCRIPO60506 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYNCRIPO60506 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYNCRIPO60506 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYNCRIPO60506 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYNCRIPO60506 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SYNCRIPO60506 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYNCRIPO60506 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYNCRIPO60506 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYNCRIPO60506 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYNCRIPO60506 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYNCRIPO60506 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYNCRIPO60506 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYNCRIPO60506 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYNCRIPO60506 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms