Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
PTPRTO14522 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC41.86■■■■■ 4.29
PTPRTO14522 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
PTPRTO14522 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.84■■■■■ 4.29
PTPRTO14522 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
PTPRTO14522 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC41.83■■■■■ 4.29
PTPRTO14522 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
PTPRTO14522 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC41.79■■■■■ 4.28
PTPRTO14522 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
PTPRTO14522 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC41.76■■■■■ 4.28
PTPRTO14522 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
PTPRTO14522 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC41.75■■■■■ 4.27
PTPRTO14522 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.7■■■■■ 4.27
PTPRTO14522 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
PTPRTO14522 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC41.65■■■■■ 4.26
PTPRTO14522 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC41.63■■■■■ 4.26
PTPRTO14522 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC41.61■■■■■ 4.25
PTPRTO14522 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC41.61■■■■■ 4.25
PTPRTO14522 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
PTPRTO14522 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
PTPRTO14522 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
PTPRTO14522 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC41.57■■■■■ 4.25
PTPRTO14522 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC41.55■■■■■ 4.24
PTPRTO14522 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC41.54■■■■■ 4.24
PTPRTO14522 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC41.51■■■■■ 4.24
PTPRTO14522 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC41.5■■■■■ 4.23
PTPRTO14522 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC41.5■■■■■ 4.23
PTPRTO14522 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
PTPRTO14522 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC41.47■■■■■ 4.23
PTPRTO14522 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
PTPRTO14522 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC41.42■■■■■ 4.22
PTPRTO14522 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
PTPRTO14522 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.39■■■■■ 4.22
PTPRTO14522 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
PTPRTO14522 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
PTPRTO14522 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
PTPRTO14522 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC41.35■■■■■ 4.21
PTPRTO14522 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC41.35■■■■■ 4.21
PTPRTO14522 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
PTPRTO14522 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC41.33■■■■■ 4.21
PTPRTO14522 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.32■■■■■ 4.21
PTPRTO14522 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.21
PTPRTO14522 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC41.32■■■■■ 4.21
PTPRTO14522 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC41.31■■■■■ 4.2
PTPRTO14522 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
PTPRTO14522 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC41.3■■■■■ 4.2
PTPRTO14522 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC41.28■■■■■ 4.2
PTPRTO14522 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
PTPRTO14522 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
PTPRTO14522 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
PTPRTO14522 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
PTPRTO14522 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC41.22■■■■■ 4.19
PTPRTO14522 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC41.2■■■■■ 4.19
PTPRTO14522 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
PTPRTO14522 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
PTPRTO14522 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC41.18■■■■■ 4.18
PTPRTO14522 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
PTPRTO14522 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
PTPRTO14522 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
PTPRTO14522 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.14■■■■■ 4.18
PTPRTO14522 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
PTPRTO14522 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
PTPRTO14522 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC41.11■■■■■ 4.17
PTPRTO14522 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC41.11■■■■■ 4.17
PTPRTO14522 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
PTPRTO14522 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC41.06■■■■■ 4.16
PTPRTO14522 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC41.06■■■■■ 4.16
PTPRTO14522 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
PTPRTO14522 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC41.05■■■■■ 4.16
PTPRTO14522 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.05■■■■■ 4.16
PTPRTO14522 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
PTPRTO14522 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC41.04■■■■■ 4.16
PTPRTO14522 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC41.03■■■■■ 4.16
PTPRTO14522 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
PTPRTO14522 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
PTPRTO14522 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
PTPRTO14522 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
PTPRTO14522 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
PTPRTO14522 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC40.98■■■■■ 4.15
PTPRTO14522 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC40.95■■■■■ 4.15
PTPRTO14522 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
PTPRTO14522 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
PTPRTO14522 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
PTPRTO14522 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.91■■■■■ 4.14
PTPRTO14522 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
PTPRTO14522 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
PTPRTO14522 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC40.87■■■■■ 4.13
PTPRTO14522 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC40.87■■■■■ 4.13
PTPRTO14522 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC40.85■■■■■ 4.13
PTPRTO14522 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
PTPRTO14522 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC40.84■■■■■ 4.13
PTPRTO14522 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC40.84■■■■■ 4.13
PTPRTO14522 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
PTPRTO14522 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC40.83■■■■■ 4.13
PTPRTO14522 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
PTPRTO14522 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
PTPRTO14522 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
PTPRTO14522 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC40.79■■■■■ 4.12
PTPRTO14522 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
PTPRTO14522 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
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