Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms