Protein–RNA interactions for Protein: B0FP48

UPK3BL1, Uroplakin-3b-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BL1B0FP48 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
UPK3BL1B0FP48 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UPK3BL1B0FP48 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UPK3BL1B0FP48 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UPK3BL1B0FP48 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
UPK3BL1B0FP48 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
UPK3BL1B0FP48 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
UPK3BL1B0FP48 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
UPK3BL1B0FP48 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
UPK3BL1B0FP48 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
UPK3BL1B0FP48 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UPK3BL1B0FP48 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
UPK3BL1B0FP48 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
UPK3BL1B0FP48 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
UPK3BL1B0FP48 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
UPK3BL1B0FP48 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UPK3BL1B0FP48 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UPK3BL1B0FP48 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
UPK3BL1B0FP48 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UPK3BL1B0FP48 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UPK3BL1B0FP48 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
UPK3BL1B0FP48 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UPK3BL1B0FP48 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
UPK3BL1B0FP48 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
UPK3BL1B0FP48 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UPK3BL1B0FP48 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UPK3BL1B0FP48 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UPK3BL1B0FP48 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UPK3BL1B0FP48 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UPK3BL1B0FP48 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UPK3BL1B0FP48 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UPK3BL1B0FP48 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
UPK3BL1B0FP48 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UPK3BL1B0FP48 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UPK3BL1B0FP48 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
UPK3BL1B0FP48 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
UPK3BL1B0FP48 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
UPK3BL1B0FP48 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
UPK3BL1B0FP48 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UPK3BL1B0FP48 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UPK3BL1B0FP48 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
UPK3BL1B0FP48 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
UPK3BL1B0FP48 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UPK3BL1B0FP48 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
UPK3BL1B0FP48 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
UPK3BL1B0FP48 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
UPK3BL1B0FP48 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UPK3BL1B0FP48 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UPK3BL1B0FP48 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
UPK3BL1B0FP48 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UPK3BL1B0FP48 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
UPK3BL1B0FP48 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
UPK3BL1B0FP48 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
UPK3BL1B0FP48 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
UPK3BL1B0FP48 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
UPK3BL1B0FP48 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.04
UPK3BL1B0FP48 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
UPK3BL1B0FP48 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
UPK3BL1B0FP48 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
UPK3BL1B0FP48 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
UPK3BL1B0FP48 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
UPK3BL1B0FP48 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
UPK3BL1B0FP48 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
UPK3BL1B0FP48 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
UPK3BL1B0FP48 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
UPK3BL1B0FP48 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
UPK3BL1B0FP48 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
UPK3BL1B0FP48 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
UPK3BL1B0FP48 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
UPK3BL1B0FP48 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
UPK3BL1B0FP48 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UPK3BL1B0FP48 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
UPK3BL1B0FP48 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UPK3BL1B0FP48 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UPK3BL1B0FP48 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
UPK3BL1B0FP48 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
UPK3BL1B0FP48 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
UPK3BL1B0FP48 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
UPK3BL1B0FP48 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
UPK3BL1B0FP48 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
UPK3BL1B0FP48 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
UPK3BL1B0FP48 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UPK3BL1B0FP48 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
UPK3BL1B0FP48 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
UPK3BL1B0FP48 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
UPK3BL1B0FP48 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
UPK3BL1B0FP48 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
UPK3BL1B0FP48 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
UPK3BL1B0FP48 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
UPK3BL1B0FP48 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
UPK3BL1B0FP48 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
UPK3BL1B0FP48 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
UPK3BL1B0FP48 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
UPK3BL1B0FP48 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
UPK3BL1B0FP48 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
UPK3BL1B0FP48 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
UPK3BL1B0FP48 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UPK3BL1B0FP48 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UPK3BL1B0FP48 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UPK3BL1B0FP48 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms