Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
USP17L4A6NCW7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
USP17L4A6NCW7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
USP17L4A6NCW7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
USP17L4A6NCW7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
USP17L4A6NCW7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
USP17L4A6NCW7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
USP17L4A6NCW7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
USP17L4A6NCW7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
USP17L4A6NCW7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
USP17L4A6NCW7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
USP17L4A6NCW7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
USP17L4A6NCW7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
USP17L4A6NCW7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
USP17L4A6NCW7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
USP17L4A6NCW7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
USP17L4A6NCW7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
USP17L4A6NCW7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
USP17L4A6NCW7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC34.05■■■■□ 3.04
USP17L4A6NCW7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
USP17L4A6NCW7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
USP17L4A6NCW7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
USP17L4A6NCW7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
USP17L4A6NCW7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
USP17L4A6NCW7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
USP17L4A6NCW7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
USP17L4A6NCW7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
USP17L4A6NCW7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
USP17L4A6NCW7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
USP17L4A6NCW7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
USP17L4A6NCW7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
USP17L4A6NCW7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
USP17L4A6NCW7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
USP17L4A6NCW7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
USP17L4A6NCW7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
USP17L4A6NCW7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
USP17L4A6NCW7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
USP17L4A6NCW7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
USP17L4A6NCW7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
USP17L4A6NCW7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
USP17L4A6NCW7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
USP17L4A6NCW7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
USP17L4A6NCW7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
USP17L4A6NCW7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
USP17L4A6NCW7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
USP17L4A6NCW7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
USP17L4A6NCW7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
USP17L4A6NCW7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
USP17L4A6NCW7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
USP17L4A6NCW7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
USP17L4A6NCW7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
USP17L4A6NCW7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
USP17L4A6NCW7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
USP17L4A6NCW7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
USP17L4A6NCW7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
USP17L4A6NCW7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
USP17L4A6NCW7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
USP17L4A6NCW7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
USP17L4A6NCW7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
USP17L4A6NCW7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
USP17L4A6NCW7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
USP17L4A6NCW7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
USP17L4A6NCW7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
USP17L4A6NCW7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
USP17L4A6NCW7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
USP17L4A6NCW7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.98
USP17L4A6NCW7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
USP17L4A6NCW7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
USP17L4A6NCW7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
USP17L4A6NCW7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
USP17L4A6NCW7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
USP17L4A6NCW7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
USP17L4A6NCW7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
USP17L4A6NCW7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
USP17L4A6NCW7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
USP17L4A6NCW7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
USP17L4A6NCW7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
USP17L4A6NCW7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
USP17L4A6NCW7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
USP17L4A6NCW7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
USP17L4A6NCW7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
USP17L4A6NCW7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
USP17L4A6NCW7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
USP17L4A6NCW7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
USP17L4A6NCW7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
USP17L4A6NCW7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
USP17L4A6NCW7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
USP17L4A6NCW7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
USP17L4A6NCW7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
USP17L4A6NCW7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
USP17L4A6NCW7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
USP17L4A6NCW7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
USP17L4A6NCW7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
USP17L4A6NCW7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
USP17L4A6NCW7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
USP17L4A6NCW7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
USP17L4A6NCW7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
USP17L4A6NCW7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
USP17L4A6NCW7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
USP17L4A6NCW7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms