Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00862A6NCI5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00862A6NCI5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00862A6NCI5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00862A6NCI5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC00862A6NCI5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00862A6NCI5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00862A6NCI5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00862A6NCI5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LINC00862A6NCI5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LINC00862A6NCI5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00862A6NCI5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00862A6NCI5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00862A6NCI5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00862A6NCI5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00862A6NCI5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00862A6NCI5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00862A6NCI5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00862A6NCI5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00862A6NCI5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00862A6NCI5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00862A6NCI5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00862A6NCI5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00862A6NCI5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00862A6NCI5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00862A6NCI5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00862A6NCI5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00862A6NCI5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00862A6NCI5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC00862A6NCI5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00862A6NCI5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00862A6NCI5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00862A6NCI5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00862A6NCI5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00862A6NCI5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00862A6NCI5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00862A6NCI5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00862A6NCI5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC00862A6NCI5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00862A6NCI5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00862A6NCI5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00862A6NCI5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00862A6NCI5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00862A6NCI5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00862A6NCI5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00862A6NCI5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00862A6NCI5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00862A6NCI5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00862A6NCI5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00862A6NCI5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00862A6NCI5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00862A6NCI5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00862A6NCI5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00862A6NCI5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00862A6NCI5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00862A6NCI5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00862A6NCI5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00862A6NCI5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00862A6NCI5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00862A6NCI5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00862A6NCI5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00862A6NCI5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00862A6NCI5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00862A6NCI5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00862A6NCI5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LINC00862A6NCI5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00862A6NCI5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00862A6NCI5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00862A6NCI5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00862A6NCI5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00862A6NCI5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00862A6NCI5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00862A6NCI5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00862A6NCI5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00862A6NCI5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00862A6NCI5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00862A6NCI5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00862A6NCI5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00862A6NCI5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00862A6NCI5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00862A6NCI5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00862A6NCI5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00862A6NCI5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00862A6NCI5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00862A6NCI5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00862A6NCI5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00862A6NCI5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00862A6NCI5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00862A6NCI5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00862A6NCI5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00862A6NCI5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00862A6NCI5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00862A6NCI5 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00862A6NCI5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00862A6NCI5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00862A6NCI5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00862A6NCI5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00862A6NCI5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00862A6NCI5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00862A6NCI5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms