Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
SETD1BQ9UPS6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
SETD1BQ9UPS6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SETD1BQ9UPS6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SETD1BQ9UPS6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SETD1BQ9UPS6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
SETD1BQ9UPS6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
SETD1BQ9UPS6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
SETD1BQ9UPS6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
SETD1BQ9UPS6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SETD1BQ9UPS6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
SETD1BQ9UPS6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
SETD1BQ9UPS6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SETD1BQ9UPS6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SETD1BQ9UPS6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SETD1BQ9UPS6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
SETD1BQ9UPS6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SETD1BQ9UPS6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SETD1BQ9UPS6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SETD1BQ9UPS6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SETD1BQ9UPS6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SETD1BQ9UPS6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SETD1BQ9UPS6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SETD1BQ9UPS6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SETD1BQ9UPS6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SETD1BQ9UPS6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SETD1BQ9UPS6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SETD1BQ9UPS6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SETD1BQ9UPS6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SETD1BQ9UPS6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SETD1BQ9UPS6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
SETD1BQ9UPS6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
SETD1BQ9UPS6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SETD1BQ9UPS6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SETD1BQ9UPS6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
SETD1BQ9UPS6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SETD1BQ9UPS6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SETD1BQ9UPS6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SETD1BQ9UPS6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SETD1BQ9UPS6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SETD1BQ9UPS6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
SETD1BQ9UPS6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SETD1BQ9UPS6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SETD1BQ9UPS6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SETD1BQ9UPS6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SETD1BQ9UPS6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
SETD1BQ9UPS6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
SETD1BQ9UPS6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
SETD1BQ9UPS6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
SETD1BQ9UPS6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC32.95■■■□□ 2.87
SETD1BQ9UPS6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
SETD1BQ9UPS6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
SETD1BQ9UPS6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
SETD1BQ9UPS6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
SETD1BQ9UPS6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SETD1BQ9UPS6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SETD1BQ9UPS6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SETD1BQ9UPS6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SETD1BQ9UPS6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SETD1BQ9UPS6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SETD1BQ9UPS6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SETD1BQ9UPS6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
SETD1BQ9UPS6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
SETD1BQ9UPS6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SETD1BQ9UPS6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SETD1BQ9UPS6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SETD1BQ9UPS6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SETD1BQ9UPS6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SETD1BQ9UPS6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SETD1BQ9UPS6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SETD1BQ9UPS6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SETD1BQ9UPS6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SETD1BQ9UPS6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SETD1BQ9UPS6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
SETD1BQ9UPS6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SETD1BQ9UPS6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SETD1BQ9UPS6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SETD1BQ9UPS6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SETD1BQ9UPS6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SETD1BQ9UPS6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SETD1BQ9UPS6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SETD1BQ9UPS6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SETD1BQ9UPS6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SETD1BQ9UPS6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SETD1BQ9UPS6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SETD1BQ9UPS6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SETD1BQ9UPS6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SETD1BQ9UPS6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SETD1BQ9UPS6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SETD1BQ9UPS6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SETD1BQ9UPS6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SETD1BQ9UPS6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.85
SETD1BQ9UPS6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
SETD1BQ9UPS6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.85
SETD1BQ9UPS6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC32.89■■■□□ 2.85
SETD1BQ9UPS6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC32.89■■■□□ 2.85
SETD1BQ9UPS6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SETD1BQ9UPS6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SETD1BQ9UPS6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SETD1BQ9UPS6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms