Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNNI3KQ59H18 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNNI3KQ59H18 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNNI3KQ59H18 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNNI3KQ59H18 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNNI3KQ59H18 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TNNI3KQ59H18 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNNI3KQ59H18 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNNI3KQ59H18 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNNI3KQ59H18 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNNI3KQ59H18 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNNI3KQ59H18 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNNI3KQ59H18 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TNNI3KQ59H18 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TNNI3KQ59H18 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TNNI3KQ59H18 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNNI3KQ59H18 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNNI3KQ59H18 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNNI3KQ59H18 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNNI3KQ59H18 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNNI3KQ59H18 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNNI3KQ59H18 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNNI3KQ59H18 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNNI3KQ59H18 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNNI3KQ59H18 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNNI3KQ59H18 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNNI3KQ59H18 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TNNI3KQ59H18 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNNI3KQ59H18 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNNI3KQ59H18 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNNI3KQ59H18 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
TNNI3KQ59H18 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TNNI3KQ59H18 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNNI3KQ59H18 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TNNI3KQ59H18 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNNI3KQ59H18 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TNNI3KQ59H18 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TNNI3KQ59H18 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNNI3KQ59H18 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNNI3KQ59H18 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TNNI3KQ59H18 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TNNI3KQ59H18 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TNNI3KQ59H18 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNNI3KQ59H18 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNNI3KQ59H18 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNNI3KQ59H18 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TNNI3KQ59H18 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TNNI3KQ59H18 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TNNI3KQ59H18 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TNNI3KQ59H18 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TNNI3KQ59H18 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNNI3KQ59H18 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNNI3KQ59H18 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNNI3KQ59H18 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNNI3KQ59H18 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNNI3KQ59H18 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TNNI3KQ59H18 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNNI3KQ59H18 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
TNNI3KQ59H18 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TNNI3KQ59H18 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNNI3KQ59H18 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TNNI3KQ59H18 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TNNI3KQ59H18 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TNNI3KQ59H18 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNNI3KQ59H18 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TNNI3KQ59H18 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TNNI3KQ59H18 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TNNI3KQ59H18 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TNNI3KQ59H18 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNNI3KQ59H18 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNNI3KQ59H18 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TNNI3KQ59H18 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TNNI3KQ59H18 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNNI3KQ59H18 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNNI3KQ59H18 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNNI3KQ59H18 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNNI3KQ59H18 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TNNI3KQ59H18 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNNI3KQ59H18 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TNNI3KQ59H18 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNNI3KQ59H18 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TNNI3KQ59H18 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TNNI3KQ59H18 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNNI3KQ59H18 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNNI3KQ59H18 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TNNI3KQ59H18 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TNNI3KQ59H18 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNNI3KQ59H18 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNNI3KQ59H18 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNNI3KQ59H18 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TNNI3KQ59H18 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
TNNI3KQ59H18 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms