Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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SS18Q15532 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SS18Q15532 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SS18Q15532 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SS18Q15532 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SS18Q15532 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SS18Q15532 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SS18Q15532 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SS18Q15532 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SS18Q15532 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SS18Q15532 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SS18Q15532 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SS18Q15532 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SS18Q15532 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SS18Q15532 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SS18Q15532 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SS18Q15532 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SS18Q15532 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SS18Q15532 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SS18Q15532 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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SS18Q15532 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SS18Q15532 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SS18Q15532 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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SS18Q15532 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SS18Q15532 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SS18Q15532 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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SS18Q15532 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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SS18Q15532 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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SS18Q15532 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SS18Q15532 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SS18Q15532 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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SS18Q15532 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SS18Q15532 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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SS18Q15532 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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SS18Q15532 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SS18Q15532 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SS18Q15532 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SS18Q15532 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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SS18Q15532 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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SS18Q15532 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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SS18Q15532 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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SS18Q15532 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SS18Q15532 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SS18Q15532 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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SS18Q15532 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SS18Q15532 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SS18Q15532 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SS18Q15532 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SS18Q15532 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SS18Q15532 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SS18Q15532 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SS18Q15532 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SS18Q15532 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SS18Q15532 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SS18Q15532 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SS18Q15532 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SS18Q15532 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SS18Q15532 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SS18Q15532 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SS18Q15532 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SS18Q15532 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SS18Q15532 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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