RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265109.7

RAI14-201, Transcript of retinoic acid induced 14, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAI14, Length 5,092 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAI14-201ENST00000265109 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.98■■■■□ 3.19
RAI14-201ENST00000265109 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.28■■■■□ 3.08
RAI14-201ENST00000265109 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.86■■■□□ 2.85
RAI14-201ENST00000265109 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.51■■■□□ 2.79
RAI14-201ENST00000265109 EHMT2Q96KQ7 1210 aa31.49■■■□□ 2.63
RAI14-201ENST00000265109 APLP2Q06481 763 aa31.06■■■□□ 2.56
RAI14-201ENST00000265109 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.92■■■□□ 2.54
RAI14-201ENST00000265109 TRIM41Q8WV44 630 aa30.56■■■□□ 2.48
RAI14-201ENST00000265109 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
RAI14-201ENST00000265109 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP30.34■■■□□ 2.45
RAI14-201ENST00000265109 UBTFP17480 764 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
RAI14-201ENST00000265109 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP30.13■■■□□ 2.41
RAI14-201ENST00000265109 PCGF6Q9BYE7 350 aa30.04■■■□□ 2.4
RAI14-201ENST00000265109 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
RAI14-201ENST00000265109 ABCC9O60706 1549 aa29.72■■■□□ 2.35
RAI14-201ENST00000265109 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP29.64■■■□□ 2.34
RAI14-201ENST00000265109 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
RAI14-201ENST00000265109 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.44■■■□□ 2.3
RAI14-201ENST00000265109 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
RAI14-201ENST00000265109 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.27
RAI14-201ENST00000265109 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
RAI14-201ENST00000265109 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.24■■■□□ 2.27
RAI14-201ENST00000265109 MYT1LQ9UL68 1186 aa29.06■■■□□ 2.24
RAI14-201ENST00000265109 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.05■■■□□ 2.24
RAI14-201ENST00000265109 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
RAI14-201ENST00000265109 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
RAI14-201ENST00000265109 ITGAEP38570 1179 aa28.99■■■□□ 2.23
RAI14-201ENST00000265109 NEFLP07196 543 aa28.56■■■□□ 2.16
RAI14-201ENST00000265109 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
RAI14-201ENST00000265109 POLR3GLQ9BT43 218 aa28.47■■■□□ 2.15
RAI14-201ENST00000265109 FBLN2P98095 1184 aa28.46■■■□□ 2.15
RAI14-201ENST00000265109 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
RAI14-201ENST00000265109 SCRIBQ14160 1630 aa28.37■■■□□ 2.13
RAI14-201ENST00000265109 ERICH6Q7L0X2 663 aa28.36■■■□□ 2.13
RAI14-201ENST00000265109 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
RAI14-201ENST00000265109 HRCP23327 699 aa28.3■■■□□ 2.12
RAI14-201ENST00000265109 TRIM52Q96A61 297 aa28.19■■■□□ 2.1
RAI14-201ENST00000265109 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.19■■■□□ 2.1
RAI14-201ENST00000265109 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.17■■■□□ 2.1
RAI14-201ENST00000265109 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
RAI14-201ENST00000265109 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
RAI14-201ENST00000265109 P3H3Q8IVL6 736 aa28.02■■■□□ 2.08
RAI14-201ENST00000265109 NEUROD1Q13562 356 aa27.91■■■□□ 2.06
RAI14-201ENST00000265109 ARID3CA6NKF2 412 aa27.9■■■□□ 2.06
RAI14-201ENST00000265109 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
RAI14-201ENST00000265109 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.84■■■□□ 2.05
RAI14-201ENST00000265109 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
RAI14-201ENST00000265109 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
RAI14-201ENST00000265109 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.03
RAI14-201ENST00000265109 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.57■■■□□ 2
RAI14-201ENST00000265109 NACADO15069 1562 aa27.57■■■□□ 2
RAI14-201ENST00000265109 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP27.57■■■□□ 2
RAI14-201ENST00000265109 BCANQ96GW7 911 aa27.46■■□□□ 1.99
RAI14-201ENST00000265109 ANP32CO43423 234 aa27.42■■□□□ 1.98
RAI14-201ENST00000265109 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
RAI14-201ENST00000265109 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
RAI14-201ENST00000265109 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
RAI14-201ENST00000265109 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
RAI14-201ENST00000265109 CLSPNQ9HAW4 1339 aa27.27■■□□□ 1.96
RAI14-201ENST00000265109 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
RAI14-201ENST00000265109 STAG3Q9UJ98 1225 aa27.18■■□□□ 1.94
RAI14-201ENST00000265109 CHGAP10645 457 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
RAI14-201ENST00000265109 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.16■■□□□ 1.94
RAI14-201ENST00000265109 TSPY4P0CV99 314 aa27.16■■□□□ 1.94
RAI14-201ENST00000265109 TSPY10P0CW01 314 aa27.16■■□□□ 1.94
RAI14-201ENST00000265109 NEFMP07197 916 aa27.14■■□□□ 1.94
RAI14-201ENST00000265109 TONSLQ96HA7 1378 aa27.13■■□□□ 1.93
RAI14-201ENST00000265109 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.13■■□□□ 1.93
RAI14-201ENST00000265109 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.1■■□□□ 1.93
RAI14-201ENST00000265109 CLIP1P30622 1438 aa27.1■■□□□ 1.93
RAI14-201ENST00000265109 EEA1Q15075 1411 aa27.1■■□□□ 1.93
RAI14-201ENST00000265109 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.07■■□□□ 1.92
RAI14-201ENST00000265109 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP27.05■■□□□ 1.924e-7■■■■□ 23.1
RAI14-201ENST00000265109 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
RAI14-201ENST00000265109 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27.01■■□□□ 1.92
RAI14-201ENST00000265109 SLC24A1O60721 1099 aa27.01■■□□□ 1.91
RAI14-201ENST00000265109 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
RAI14-201ENST00000265109 KIF27Q86VH2 1401 aa26.97■■□□□ 1.91
RAI14-201ENST00000265109 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.95■■□□□ 1.9
RAI14-201ENST00000265109 GOLGA3Q08378 1498 aa26.94■■□□□ 1.9
RAI14-201ENST00000265109 CANXP27824 592 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
RAI14-201ENST00000265109 ERCC6Q03468 1493 aa26.91■■□□□ 1.9
RAI14-201ENST00000265109 KCNH8Q96L42 1107 aa26.91■■□□□ 1.9
RAI14-201ENST00000265109 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.88■■□□□ 1.89
RAI14-201ENST00000265109 CEP162Q5TB80 1403 aa26.79■■□□□ 1.88
RAI14-201ENST00000265109 MYT1Q01538 1121 aa26.76■■□□□ 1.87
RAI14-201ENST00000265109 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.74■■□□□ 1.87
RAI14-201ENST00000265109 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa26.74■■□□□ 1.87
RAI14-201ENST00000265109 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.73■■□□□ 1.87
RAI14-201ENST00000265109 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa26.72■■□□□ 1.87
RAI14-201ENST00000265109 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
RAI14-201ENST00000265109 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
RAI14-201ENST00000265109 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
RAI14-201ENST00000265109 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.69■■□□□ 1.86
RAI14-201ENST00000265109 BCL11AQ9H165 835 aa26.65■■□□□ 1.86
RAI14-201ENST00000265109 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
RAI14-201ENST00000265109 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.54■■□□□ 1.84
RAI14-201ENST00000265109 CUX2O14529 1486 aa26.54■■□□□ 1.84
RAI14-201ENST00000265109 FAM9BQ8IZU0 186 aa26.54■■□□□ 1.84
RAI14-201ENST00000265109 TMC1Q8TDI8 760 aa26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 6.9 ms