Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRJQ12913 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRJQ12913 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRJQ12913 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRJQ12913 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRJQ12913 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRJQ12913 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRJQ12913 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRJQ12913 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRJQ12913 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRJQ12913 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRJQ12913 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRJQ12913 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRJQ12913 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRJQ12913 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRJQ12913 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRJQ12913 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRJQ12913 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRJQ12913 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRJQ12913 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRJQ12913 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPRJQ12913 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPRJQ12913 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPRJQ12913 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRJQ12913 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRJQ12913 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRJQ12913 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRJQ12913 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRJQ12913 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRJQ12913 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRJQ12913 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRJQ12913 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRJQ12913 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRJQ12913 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRJQ12913 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRJQ12913 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRJQ12913 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRJQ12913 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRJQ12913 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRJQ12913 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRJQ12913 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRJQ12913 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRJQ12913 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRJQ12913 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRJQ12913 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRJQ12913 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRJQ12913 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRJQ12913 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRJQ12913 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRJQ12913 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRJQ12913 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRJQ12913 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRJQ12913 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRJQ12913 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRJQ12913 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRJQ12913 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRJQ12913 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRJQ12913 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRJQ12913 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRJQ12913 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRJQ12913 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRJQ12913 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRJQ12913 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRJQ12913 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRJQ12913 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRJQ12913 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRJQ12913 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRJQ12913 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRJQ12913 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRJQ12913 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRJQ12913 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRJQ12913 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRJQ12913 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRJQ12913 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRJQ12913 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRJQ12913 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRJQ12913 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRJQ12913 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRJQ12913 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRJQ12913 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRJQ12913 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRJQ12913 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRJQ12913 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRJQ12913 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRJQ12913 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRJQ12913 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRJQ12913 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRJQ12913 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRJQ12913 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRJQ12913 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRJQ12913 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRJQ12913 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRJQ12913 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRJQ12913 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRJQ12913 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRJQ12913 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRJQ12913 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRJQ12913 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRJQ12913 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRJQ12913 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
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