Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GTF2IP78347 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GTF2IP78347 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTF2IP78347 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTF2IP78347 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTF2IP78347 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTF2IP78347 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GTF2IP78347 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GTF2IP78347 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GTF2IP78347 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
GTF2IP78347 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GTF2IP78347 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GTF2IP78347 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GTF2IP78347 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GTF2IP78347 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GTF2IP78347 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GTF2IP78347 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GTF2IP78347 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GTF2IP78347 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GTF2IP78347 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GTF2IP78347 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GTF2IP78347 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GTF2IP78347 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GTF2IP78347 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GTF2IP78347 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
GTF2IP78347 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GTF2IP78347 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GTF2IP78347 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GTF2IP78347 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GTF2IP78347 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GTF2IP78347 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GTF2IP78347 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
GTF2IP78347 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GTF2IP78347 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GTF2IP78347 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GTF2IP78347 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
GTF2IP78347 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms