Protein–RNA interactions for Protein: P41732

TSPAN7, Tetraspanin-7, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN7P41732 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TSPAN7P41732 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TSPAN7P41732 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN7P41732 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN7P41732 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN7P41732 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN7P41732 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN7P41732 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN7P41732 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN7P41732 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN7P41732 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN7P41732 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN7P41732 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN7P41732 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN7P41732 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN7P41732 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN7P41732 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN7P41732 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN7P41732 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN7P41732 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN7P41732 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN7P41732 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN7P41732 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN7P41732 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN7P41732 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN7P41732 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN7P41732 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN7P41732 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN7P41732 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN7P41732 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN7P41732 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN7P41732 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN7P41732 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN7P41732 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN7P41732 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN7P41732 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN7P41732 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN7P41732 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN7P41732 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN7P41732 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN7P41732 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN7P41732 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN7P41732 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN7P41732 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN7P41732 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN7P41732 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN7P41732 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN7P41732 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN7P41732 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN7P41732 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN7P41732 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN7P41732 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN7P41732 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN7P41732 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN7P41732 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN7P41732 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN7P41732 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN7P41732 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN7P41732 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN7P41732 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN7P41732 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN7P41732 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN7P41732 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN7P41732 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN7P41732 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN7P41732 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN7P41732 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN7P41732 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN7P41732 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN7P41732 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN7P41732 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN7P41732 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN7P41732 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN7P41732 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.7 ms