Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA6P31267 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA6P31267 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA6P31267 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA6P31267 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA6P31267 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA6P31267 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA6P31267 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA6P31267 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA6P31267 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA6P31267 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA6P31267 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA6P31267 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA6P31267 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA6P31267 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA6P31267 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA6P31267 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA6P31267 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA6P31267 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA6P31267 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA6P31267 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA6P31267 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA6P31267 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA6P31267 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA6P31267 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA6P31267 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA6P31267 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA6P31267 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA6P31267 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA6P31267 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA6P31267 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA6P31267 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA6P31267 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA6P31267 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA6P31267 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA6P31267 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA6P31267 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA6P31267 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA6P31267 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms