Protein–RNA interactions for Protein: O60658

PDE8A, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8A, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8AO60658 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE8AO60658 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE8AO60658 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE8AO60658 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE8AO60658 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE8AO60658 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE8AO60658 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE8AO60658 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDE8AO60658 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDE8AO60658 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDE8AO60658 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDE8AO60658 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDE8AO60658 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PDE8AO60658 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDE8AO60658 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE8AO60658 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE8AO60658 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE8AO60658 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE8AO60658 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE8AO60658 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE8AO60658 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE8AO60658 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE8AO60658 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE8AO60658 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE8AO60658 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE8AO60658 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE8AO60658 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE8AO60658 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE8AO60658 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE8AO60658 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE8AO60658 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE8AO60658 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE8AO60658 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE8AO60658 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE8AO60658 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE8AO60658 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE8AO60658 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE8AO60658 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE8AO60658 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE8AO60658 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE8AO60658 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE8AO60658 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE8AO60658 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE8AO60658 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE8AO60658 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE8AO60658 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE8AO60658 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PDE8AO60658 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PDE8AO60658 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDE8AO60658 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDE8AO60658 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PDE8AO60658 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PDE8AO60658 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PDE8AO60658 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDE8AO60658 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE8AO60658 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE8AO60658 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE8AO60658 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE8AO60658 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE8AO60658 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE8AO60658 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE8AO60658 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE8AO60658 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE8AO60658 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE8AO60658 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE8AO60658 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE8AO60658 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE8AO60658 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE8AO60658 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE8AO60658 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE8AO60658 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE8AO60658 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE8AO60658 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE8AO60658 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE8AO60658 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE8AO60658 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE8AO60658 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE8AO60658 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE8AO60658 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE8AO60658 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE8AO60658 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE8AO60658 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE8AO60658 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE8AO60658 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE8AO60658 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE8AO60658 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE8AO60658 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE8AO60658 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE8AO60658 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE8AO60658 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE8AO60658 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE8AO60658 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE8AO60658 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE8AO60658 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE8AO60658 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE8AO60658 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PDE8AO60658 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PDE8AO60658 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PDE8AO60658 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PDE8AO60658 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms