Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UTP11Q9Y3A2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UTP11Q9Y3A2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UTP11Q9Y3A2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UTP11Q9Y3A2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UTP11Q9Y3A2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
UTP11Q9Y3A2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UTP11Q9Y3A2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UTP11Q9Y3A2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UTP11Q9Y3A2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UTP11Q9Y3A2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UTP11Q9Y3A2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UTP11Q9Y3A2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
UTP11Q9Y3A2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UTP11Q9Y3A2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UTP11Q9Y3A2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UTP11Q9Y3A2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UTP11Q9Y3A2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UTP11Q9Y3A2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UTP11Q9Y3A2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UTP11Q9Y3A2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UTP11Q9Y3A2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UTP11Q9Y3A2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
UTP11Q9Y3A2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
UTP11Q9Y3A2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UTP11Q9Y3A2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UTP11Q9Y3A2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UTP11Q9Y3A2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UTP11Q9Y3A2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UTP11Q9Y3A2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UTP11Q9Y3A2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UTP11Q9Y3A2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UTP11Q9Y3A2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UTP11Q9Y3A2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UTP11Q9Y3A2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UTP11Q9Y3A2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UTP11Q9Y3A2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UTP11Q9Y3A2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UTP11Q9Y3A2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UTP11Q9Y3A2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UTP11Q9Y3A2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UTP11Q9Y3A2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UTP11Q9Y3A2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UTP11Q9Y3A2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UTP11Q9Y3A2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UTP11Q9Y3A2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UTP11Q9Y3A2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UTP11Q9Y3A2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UTP11Q9Y3A2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UTP11Q9Y3A2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UTP11Q9Y3A2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
UTP11Q9Y3A2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UTP11Q9Y3A2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UTP11Q9Y3A2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UTP11Q9Y3A2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UTP11Q9Y3A2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UTP11Q9Y3A2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UTP11Q9Y3A2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UTP11Q9Y3A2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UTP11Q9Y3A2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
UTP11Q9Y3A2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UTP11Q9Y3A2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UTP11Q9Y3A2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UTP11Q9Y3A2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UTP11Q9Y3A2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
UTP11Q9Y3A2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UTP11Q9Y3A2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UTP11Q9Y3A2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UTP11Q9Y3A2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UTP11Q9Y3A2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UTP11Q9Y3A2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UTP11Q9Y3A2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UTP11Q9Y3A2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UTP11Q9Y3A2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UTP11Q9Y3A2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UTP11Q9Y3A2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UTP11Q9Y3A2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
UTP11Q9Y3A2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UTP11Q9Y3A2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UTP11Q9Y3A2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
UTP11Q9Y3A2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UTP11Q9Y3A2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UTP11Q9Y3A2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UTP11Q9Y3A2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UTP11Q9Y3A2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UTP11Q9Y3A2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UTP11Q9Y3A2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UTP11Q9Y3A2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UTP11Q9Y3A2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UTP11Q9Y3A2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UTP11Q9Y3A2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UTP11Q9Y3A2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UTP11Q9Y3A2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UTP11Q9Y3A2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UTP11Q9Y3A2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UTP11Q9Y3A2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UTP11Q9Y3A2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UTP11Q9Y3A2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UTP11Q9Y3A2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UTP11Q9Y3A2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms