Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV7

PRDM9, Histone-lysine N-methyltransferase PRDM9, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM9Q9NQV7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM9Q9NQV7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM9Q9NQV7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM9Q9NQV7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM9Q9NQV7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM9Q9NQV7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM9Q9NQV7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM9Q9NQV7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM9Q9NQV7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM9Q9NQV7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRDM9Q9NQV7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRDM9Q9NQV7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PRDM9Q9NQV7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRDM9Q9NQV7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRDM9Q9NQV7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRDM9Q9NQV7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PRDM9Q9NQV7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRDM9Q9NQV7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRDM9Q9NQV7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRDM9Q9NQV7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRDM9Q9NQV7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRDM9Q9NQV7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRDM9Q9NQV7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PRDM9Q9NQV7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRDM9Q9NQV7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRDM9Q9NQV7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms