Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUM4

ARHGAP27, Rho GTPase-activating protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP27Q6ZUM4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ARHGAP27Q6ZUM4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ARHGAP27Q6ZUM4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARHGAP27Q6ZUM4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ARHGAP27Q6ZUM4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ARHGAP27Q6ZUM4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARHGAP27Q6ZUM4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARHGAP27Q6ZUM4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARHGAP27Q6ZUM4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARHGAP27Q6ZUM4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARHGAP27Q6ZUM4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ARHGAP27Q6ZUM4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ARHGAP27Q6ZUM4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARHGAP27Q6ZUM4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARHGAP27Q6ZUM4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARHGAP27Q6ZUM4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARHGAP27Q6ZUM4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARHGAP27Q6ZUM4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARHGAP27Q6ZUM4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARHGAP27Q6ZUM4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARHGAP27Q6ZUM4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARHGAP27Q6ZUM4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARHGAP27Q6ZUM4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARHGAP27Q6ZUM4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARHGAP27Q6ZUM4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARHGAP27Q6ZUM4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARHGAP27Q6ZUM4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARHGAP27Q6ZUM4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARHGAP27Q6ZUM4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ARHGAP27Q6ZUM4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGAP27Q6ZUM4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGAP27Q6ZUM4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGAP27Q6ZUM4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGAP27Q6ZUM4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGAP27Q6ZUM4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGAP27Q6ZUM4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGAP27Q6ZUM4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ARHGAP27Q6ZUM4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ARHGAP27Q6ZUM4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARHGAP27Q6ZUM4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARHGAP27Q6ZUM4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARHGAP27Q6ZUM4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARHGAP27Q6ZUM4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARHGAP27Q6ZUM4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARHGAP27Q6ZUM4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ARHGAP27Q6ZUM4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARHGAP27Q6ZUM4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARHGAP27Q6ZUM4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARHGAP27Q6ZUM4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARHGAP27Q6ZUM4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARHGAP27Q6ZUM4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARHGAP27Q6ZUM4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARHGAP27Q6ZUM4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARHGAP27Q6ZUM4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARHGAP27Q6ZUM4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARHGAP27Q6ZUM4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARHGAP27Q6ZUM4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARHGAP27Q6ZUM4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARHGAP27Q6ZUM4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ARHGAP27Q6ZUM4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARHGAP27Q6ZUM4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARHGAP27Q6ZUM4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARHGAP27Q6ZUM4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ARHGAP27Q6ZUM4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARHGAP27Q6ZUM4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARHGAP27Q6ZUM4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARHGAP27Q6ZUM4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ARHGAP27Q6ZUM4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARHGAP27Q6ZUM4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARHGAP27Q6ZUM4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ARHGAP27Q6ZUM4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARHGAP27Q6ZUM4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARHGAP27Q6ZUM4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARHGAP27Q6ZUM4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARHGAP27Q6ZUM4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARHGAP27Q6ZUM4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ARHGAP27Q6ZUM4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARHGAP27Q6ZUM4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARHGAP27Q6ZUM4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARHGAP27Q6ZUM4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARHGAP27Q6ZUM4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARHGAP27Q6ZUM4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARHGAP27Q6ZUM4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARHGAP27Q6ZUM4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARHGAP27Q6ZUM4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARHGAP27Q6ZUM4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ARHGAP27Q6ZUM4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARHGAP27Q6ZUM4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ARHGAP27Q6ZUM4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARHGAP27Q6ZUM4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARHGAP27Q6ZUM4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARHGAP27Q6ZUM4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARHGAP27Q6ZUM4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ARHGAP27Q6ZUM4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARHGAP27Q6ZUM4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARHGAP27Q6ZUM4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARHGAP27Q6ZUM4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARHGAP27Q6ZUM4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARHGAP27Q6ZUM4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARHGAP27Q6ZUM4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.2 ms