Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSSK4Q6SA08 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSSK4Q6SA08 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSSK4Q6SA08 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSSK4Q6SA08 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSSK4Q6SA08 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSSK4Q6SA08 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSSK4Q6SA08 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSSK4Q6SA08 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSSK4Q6SA08 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSSK4Q6SA08 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSSK4Q6SA08 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSSK4Q6SA08 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSSK4Q6SA08 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSSK4Q6SA08 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSSK4Q6SA08 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TSSK4Q6SA08 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSSK4Q6SA08 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSSK4Q6SA08 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSSK4Q6SA08 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSSK4Q6SA08 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSSK4Q6SA08 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSSK4Q6SA08 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSSK4Q6SA08 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSSK4Q6SA08 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSSK4Q6SA08 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSSK4Q6SA08 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
TSSK4Q6SA08 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TSSK4Q6SA08 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TSSK4Q6SA08 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSSK4Q6SA08 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSSK4Q6SA08 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSSK4Q6SA08 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSSK4Q6SA08 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSSK4Q6SA08 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSSK4Q6SA08 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSSK4Q6SA08 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSSK4Q6SA08 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSSK4Q6SA08 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TSSK4Q6SA08 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSSK4Q6SA08 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSSK4Q6SA08 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSSK4Q6SA08 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSSK4Q6SA08 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSSK4Q6SA08 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSSK4Q6SA08 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSSK4Q6SA08 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSSK4Q6SA08 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSSK4Q6SA08 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSSK4Q6SA08 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSSK4Q6SA08 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSSK4Q6SA08 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSSK4Q6SA08 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSSK4Q6SA08 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSSK4Q6SA08 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSSK4Q6SA08 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSSK4Q6SA08 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSSK4Q6SA08 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSSK4Q6SA08 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSSK4Q6SA08 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSSK4Q6SA08 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSSK4Q6SA08 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSSK4Q6SA08 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TSSK4Q6SA08 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSSK4Q6SA08 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSSK4Q6SA08 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSSK4Q6SA08 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSSK4Q6SA08 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSSK4Q6SA08 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSSK4Q6SA08 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TSSK4Q6SA08 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TSSK4Q6SA08 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSSK4Q6SA08 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSSK4Q6SA08 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSSK4Q6SA08 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSSK4Q6SA08 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSSK4Q6SA08 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSSK4Q6SA08 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSSK4Q6SA08 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSSK4Q6SA08 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSSK4Q6SA08 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSSK4Q6SA08 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSSK4Q6SA08 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSSK4Q6SA08 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TSSK4Q6SA08 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms