Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HSPB3Q12988 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HSPB3Q12988 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HSPB3Q12988 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HSPB3Q12988 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HSPB3Q12988 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HSPB3Q12988 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HSPB3Q12988 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HSPB3Q12988 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HSPB3Q12988 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HSPB3Q12988 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HSPB3Q12988 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HSPB3Q12988 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HSPB3Q12988 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HSPB3Q12988 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HSPB3Q12988 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HSPB3Q12988 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
HSPB3Q12988 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HSPB3Q12988 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HSPB3Q12988 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HSPB3Q12988 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HSPB3Q12988 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HSPB3Q12988 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
HSPB3Q12988 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HSPB3Q12988 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HSPB3Q12988 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HSPB3Q12988 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HSPB3Q12988 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HSPB3Q12988 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HSPB3Q12988 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HSPB3Q12988 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HSPB3Q12988 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HSPB3Q12988 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HSPB3Q12988 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HSPB3Q12988 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HSPB3Q12988 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
HSPB3Q12988 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HSPB3Q12988 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HSPB3Q12988 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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