Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTHFRP42898 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTHFRP42898 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTHFRP42898 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTHFRP42898 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTHFRP42898 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTHFRP42898 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MTHFRP42898 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTHFRP42898 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTHFRP42898 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTHFRP42898 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTHFRP42898 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTHFRP42898 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTHFRP42898 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTHFRP42898 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTHFRP42898 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTHFRP42898 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTHFRP42898 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTHFRP42898 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTHFRP42898 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTHFRP42898 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTHFRP42898 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTHFRP42898 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTHFRP42898 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTHFRP42898 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTHFRP42898 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTHFRP42898 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTHFRP42898 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTHFRP42898 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTHFRP42898 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTHFRP42898 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTHFRP42898 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTHFRP42898 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTHFRP42898 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTHFRP42898 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTHFRP42898 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTHFRP42898 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTHFRP42898 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTHFRP42898 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTHFRP42898 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTHFRP42898 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTHFRP42898 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTHFRP42898 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTHFRP42898 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTHFRP42898 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTHFRP42898 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTHFRP42898 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MTHFRP42898 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MTHFRP42898 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MTHFRP42898 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms