Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA6P31267 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA6P31267 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA6P31267 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA6P31267 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA6P31267 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA6P31267 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA6P31267 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA6P31267 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA6P31267 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA6P31267 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA6P31267 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA6P31267 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA6P31267 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA6P31267 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA6P31267 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA6P31267 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA6P31267 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXA6P31267 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA6P31267 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA6P31267 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA6P31267 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA6P31267 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA6P31267 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA6P31267 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA6P31267 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA6P31267 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA6P31267 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA6P31267 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA6P31267 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA6P31267 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA6P31267 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms