Protein–RNA interactions for Protein: A6NF36

CCDC182, Coiled-coil domain-containing protein 182, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC182A6NF36 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms