Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TREX1Q9NSU2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TREX1Q9NSU2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TREX1Q9NSU2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TREX1Q9NSU2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TREX1Q9NSU2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TREX1Q9NSU2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TREX1Q9NSU2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TREX1Q9NSU2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TREX1Q9NSU2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TREX1Q9NSU2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TREX1Q9NSU2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TREX1Q9NSU2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TREX1Q9NSU2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TREX1Q9NSU2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TREX1Q9NSU2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TREX1Q9NSU2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TREX1Q9NSU2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TREX1Q9NSU2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TREX1Q9NSU2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TREX1Q9NSU2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TREX1Q9NSU2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TREX1Q9NSU2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TREX1Q9NSU2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TREX1Q9NSU2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TREX1Q9NSU2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TREX1Q9NSU2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TREX1Q9NSU2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TREX1Q9NSU2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TREX1Q9NSU2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TREX1Q9NSU2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TREX1Q9NSU2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TREX1Q9NSU2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TREX1Q9NSU2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TREX1Q9NSU2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TREX1Q9NSU2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TREX1Q9NSU2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TREX1Q9NSU2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TREX1Q9NSU2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TREX1Q9NSU2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TREX1Q9NSU2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TREX1Q9NSU2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TREX1Q9NSU2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TREX1Q9NSU2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TREX1Q9NSU2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TREX1Q9NSU2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TREX1Q9NSU2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TREX1Q9NSU2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TREX1Q9NSU2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TREX1Q9NSU2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TREX1Q9NSU2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TREX1Q9NSU2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TREX1Q9NSU2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TREX1Q9NSU2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TREX1Q9NSU2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TREX1Q9NSU2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TREX1Q9NSU2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TREX1Q9NSU2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TREX1Q9NSU2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TREX1Q9NSU2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TREX1Q9NSU2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TREX1Q9NSU2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TREX1Q9NSU2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TREX1Q9NSU2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TREX1Q9NSU2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TREX1Q9NSU2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TREX1Q9NSU2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TREX1Q9NSU2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TREX1Q9NSU2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TREX1Q9NSU2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TREX1Q9NSU2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TREX1Q9NSU2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TREX1Q9NSU2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TREX1Q9NSU2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TREX1Q9NSU2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TREX1Q9NSU2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TREX1Q9NSU2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TREX1Q9NSU2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TREX1Q9NSU2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TREX1Q9NSU2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TREX1Q9NSU2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TREX1Q9NSU2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms