Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms