Protein–RNA interactions for Protein: Q9H422

HIPK3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK3Q9H422 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HIPK3Q9H422 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIPK3Q9H422 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIPK3Q9H422 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIPK3Q9H422 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIPK3Q9H422 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIPK3Q9H422 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIPK3Q9H422 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIPK3Q9H422 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HIPK3Q9H422 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HIPK3Q9H422 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HIPK3Q9H422 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HIPK3Q9H422 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HIPK3Q9H422 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HIPK3Q9H422 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HIPK3Q9H422 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HIPK3Q9H422 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIPK3Q9H422 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIPK3Q9H422 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIPK3Q9H422 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIPK3Q9H422 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIPK3Q9H422 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIPK3Q9H422 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIPK3Q9H422 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIPK3Q9H422 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HIPK3Q9H422 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HIPK3Q9H422 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HIPK3Q9H422 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HIPK3Q9H422 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HIPK3Q9H422 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HIPK3Q9H422 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HIPK3Q9H422 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HIPK3Q9H422 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HIPK3Q9H422 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HIPK3Q9H422 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
HIPK3Q9H422 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HIPK3Q9H422 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HIPK3Q9H422 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
HIPK3Q9H422 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HIPK3Q9H422 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HIPK3Q9H422 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HIPK3Q9H422 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HIPK3Q9H422 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HIPK3Q9H422 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HIPK3Q9H422 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HIPK3Q9H422 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HIPK3Q9H422 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HIPK3Q9H422 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HIPK3Q9H422 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HIPK3Q9H422 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HIPK3Q9H422 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
HIPK3Q9H422 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIPK3Q9H422 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIPK3Q9H422 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HIPK3Q9H422 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIPK3Q9H422 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIPK3Q9H422 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIPK3Q9H422 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIPK3Q9H422 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HIPK3Q9H422 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIPK3Q9H422 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIPK3Q9H422 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIPK3Q9H422 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIPK3Q9H422 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIPK3Q9H422 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HIPK3Q9H422 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HIPK3Q9H422 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIPK3Q9H422 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIPK3Q9H422 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIPK3Q9H422 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIPK3Q9H422 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HIPK3Q9H422 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HIPK3Q9H422 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HIPK3Q9H422 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HIPK3Q9H422 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HIPK3Q9H422 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HIPK3Q9H422 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HIPK3Q9H422 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HIPK3Q9H422 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HIPK3Q9H422 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HIPK3Q9H422 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HIPK3Q9H422 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HIPK3Q9H422 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HIPK3Q9H422 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HIPK3Q9H422 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HIPK3Q9H422 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIPK3Q9H422 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIPK3Q9H422 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIPK3Q9H422 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIPK3Q9H422 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIPK3Q9H422 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIPK3Q9H422 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIPK3Q9H422 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HIPK3Q9H422 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIPK3Q9H422 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIPK3Q9H422 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIPK3Q9H422 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIPK3Q9H422 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HIPK3Q9H422 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HIPK3Q9H422 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms