Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CASC2Q6XLA1 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms