Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NECTIN1Q15223 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NECTIN1Q15223 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NECTIN1Q15223 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NECTIN1Q15223 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NECTIN1Q15223 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NECTIN1Q15223 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NECTIN1Q15223 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NECTIN1Q15223 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NECTIN1Q15223 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NECTIN1Q15223 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NECTIN1Q15223 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NECTIN1Q15223 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NECTIN1Q15223 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NECTIN1Q15223 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NECTIN1Q15223 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NECTIN1Q15223 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NECTIN1Q15223 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NECTIN1Q15223 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NECTIN1Q15223 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NECTIN1Q15223 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NECTIN1Q15223 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NECTIN1Q15223 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NECTIN1Q15223 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NECTIN1Q15223 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NECTIN1Q15223 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NECTIN1Q15223 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NECTIN1Q15223 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NECTIN1Q15223 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NECTIN1Q15223 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NECTIN1Q15223 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NECTIN1Q15223 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NECTIN1Q15223 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NECTIN1Q15223 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NECTIN1Q15223 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NECTIN1Q15223 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NECTIN1Q15223 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NECTIN1Q15223 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NECTIN1Q15223 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NECTIN1Q15223 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NECTIN1Q15223 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NECTIN1Q15223 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NECTIN1Q15223 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NECTIN1Q15223 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NECTIN1Q15223 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NECTIN1Q15223 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NECTIN1Q15223 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NECTIN1Q15223 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NECTIN1Q15223 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NECTIN1Q15223 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NECTIN1Q15223 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NECTIN1Q15223 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NECTIN1Q15223 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NECTIN1Q15223 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NECTIN1Q15223 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NECTIN1Q15223 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NECTIN1Q15223 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NECTIN1Q15223 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NECTIN1Q15223 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NECTIN1Q15223 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NECTIN1Q15223 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NECTIN1Q15223 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NECTIN1Q15223 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NECTIN1Q15223 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NECTIN1Q15223 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NECTIN1Q15223 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NECTIN1Q15223 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NECTIN1Q15223 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NECTIN1Q15223 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NECTIN1Q15223 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NECTIN1Q15223 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
NECTIN1Q15223 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NECTIN1Q15223 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NECTIN1Q15223 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NECTIN1Q15223 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NECTIN1Q15223 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NECTIN1Q15223 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NECTIN1Q15223 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NECTIN1Q15223 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NECTIN1Q15223 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NECTIN1Q15223 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NECTIN1Q15223 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NECTIN1Q15223 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NECTIN1Q15223 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NECTIN1Q15223 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NECTIN1Q15223 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NECTIN1Q15223 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NECTIN1Q15223 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NECTIN1Q15223 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NECTIN1Q15223 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NECTIN1Q15223 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NECTIN1Q15223 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NECTIN1Q15223 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NECTIN1Q15223 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NECTIN1Q15223 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NECTIN1Q15223 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NECTIN1Q15223 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NECTIN1Q15223 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NECTIN1Q15223 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NECTIN1Q15223 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
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